Protein–RNA interactions for Protein: P01210

PENK, Proenkephalin-A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PENKP01210 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PENKP01210 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PENKP01210 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PENKP01210 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PENKP01210 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PENKP01210 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PENKP01210 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
PENKP01210 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PENKP01210 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PENKP01210 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PENKP01210 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PENKP01210 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PENKP01210 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PENKP01210 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PENKP01210 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PENKP01210 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PENKP01210 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PENKP01210 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PENKP01210 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PENKP01210 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PENKP01210 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PENKP01210 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PENKP01210 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PENKP01210 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PENKP01210 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PENKP01210 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PENKP01210 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PENKP01210 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PENKP01210 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PENKP01210 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PENKP01210 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PENKP01210 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PENKP01210 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PENKP01210 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PENKP01210 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PENKP01210 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PENKP01210 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PENKP01210 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PENKP01210 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PENKP01210 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PENKP01210 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PENKP01210 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PENKP01210 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PENKP01210 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PENKP01210 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PENKP01210 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PENKP01210 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PENKP01210 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PENKP01210 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PENKP01210 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PENKP01210 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PENKP01210 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PENKP01210 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PENKP01210 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PENKP01210 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PENKP01210 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PENKP01210 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PENKP01210 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PENKP01210 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PENKP01210 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PENKP01210 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PENKP01210 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PENKP01210 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PENKP01210 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PENKP01210 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PENKP01210 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PENKP01210 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PENKP01210 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PENKP01210 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PENKP01210 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PENKP01210 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PENKP01210 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PENKP01210 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PENKP01210 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PENKP01210 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PENKP01210 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PENKP01210 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PENKP01210 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PENKP01210 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PENKP01210 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PENKP01210 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PENKP01210 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PENKP01210 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PENKP01210 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PENKP01210 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PENKP01210 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PENKP01210 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PENKP01210 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PENKP01210 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PENKP01210 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PENKP01210 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PENKP01210 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PENKP01210 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PENKP01210 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PENKP01210 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PENKP01210 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PENKP01210 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PENKP01210 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PENKP01210 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PENKP01210 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms