Protein–RNA interactions for Protein: P01210

PENK, Proenkephalin-A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PENKP01210 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PENKP01210 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PENKP01210 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PENKP01210 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PENKP01210 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PENKP01210 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PENKP01210 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
PENKP01210 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PENKP01210 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PENKP01210 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PENKP01210 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PENKP01210 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PENKP01210 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PENKP01210 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PENKP01210 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PENKP01210 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PENKP01210 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PENKP01210 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PENKP01210 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PENKP01210 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PENKP01210 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PENKP01210 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PENKP01210 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PENKP01210 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PENKP01210 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PENKP01210 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PENKP01210 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PENKP01210 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PENKP01210 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PENKP01210 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PENKP01210 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PENKP01210 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PENKP01210 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PENKP01210 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PENKP01210 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PENKP01210 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PENKP01210 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PENKP01210 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PENKP01210 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PENKP01210 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PENKP01210 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PENKP01210 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PENKP01210 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PENKP01210 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PENKP01210 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PENKP01210 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PENKP01210 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PENKP01210 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PENKP01210 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PENKP01210 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PENKP01210 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PENKP01210 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PENKP01210 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PENKP01210 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PENKP01210 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PENKP01210 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PENKP01210 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PENKP01210 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PENKP01210 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PENKP01210 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PENKP01210 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PENKP01210 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PENKP01210 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PENKP01210 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PENKP01210 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PENKP01210 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PENKP01210 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PENKP01210 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PENKP01210 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PENKP01210 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PENKP01210 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PENKP01210 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PENKP01210 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PENKP01210 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PENKP01210 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PENKP01210 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PENKP01210 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PENKP01210 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PENKP01210 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PENKP01210 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PENKP01210 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PENKP01210 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PENKP01210 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PENKP01210 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PENKP01210 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PENKP01210 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PENKP01210 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PENKP01210 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PENKP01210 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PENKP01210 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PENKP01210 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PENKP01210 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PENKP01210 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PENKP01210 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PENKP01210 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PENKP01210 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PENKP01210 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PENKP01210 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PENKP01210 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PENKP01210 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms