Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOP3BO95985 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP3BO95985 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP3BO95985 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOP3BO95985 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOP3BO95985 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOP3BO95985 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP3BO95985 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP3BO95985 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOP3BO95985 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOP3BO95985 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOP3BO95985 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOP3BO95985 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TOP3BO95985 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOP3BO95985 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOP3BO95985 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP3BO95985 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP3BO95985 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP3BO95985 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP3BO95985 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP3BO95985 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP3BO95985 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP3BO95985 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP3BO95985 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP3BO95985 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP3BO95985 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP3BO95985 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP3BO95985 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP3BO95985 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP3BO95985 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP3BO95985 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOP3BO95985 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOP3BO95985 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP3BO95985 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP3BO95985 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP3BO95985 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TOP3BO95985 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TOP3BO95985 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TOP3BO95985 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOP3BO95985 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOP3BO95985 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOP3BO95985 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TOP3BO95985 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOP3BO95985 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TOP3BO95985 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TOP3BO95985 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TOP3BO95985 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TOP3BO95985 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TOP3BO95985 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TOP3BO95985 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TOP3BO95985 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TOP3BO95985 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOP3BO95985 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOP3BO95985 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOP3BO95985 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOP3BO95985 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP3BO95985 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TOP3BO95985 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOP3BO95985 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP3BO95985 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP3BO95985 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP3BO95985 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP3BO95985 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOP3BO95985 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOP3BO95985 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP3BO95985 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP3BO95985 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP3BO95985 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP3BO95985 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP3BO95985 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOP3BO95985 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOP3BO95985 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TOP3BO95985 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TOP3BO95985 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOP3BO95985 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TOP3BO95985 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOP3BO95985 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOP3BO95985 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOP3BO95985 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOP3BO95985 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP3BO95985 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP3BO95985 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOP3BO95985 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOP3BO95985 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOP3BO95985 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOP3BO95985 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOP3BO95985 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TOP3BO95985 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOP3BO95985 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP3BO95985 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOP3BO95985 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOP3BO95985 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOP3BO95985 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOP3BO95985 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOP3BO95985 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TOP3BO95985 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TOP3BO95985 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TOP3BO95985 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TOP3BO95985 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TOP3BO95985 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms