Protein–RNA interactions for Protein: O95977

S1PR4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR4O95977 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
S1PR4O95977 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
S1PR4O95977 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
S1PR4O95977 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
S1PR4O95977 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
S1PR4O95977 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
S1PR4O95977 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
S1PR4O95977 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
S1PR4O95977 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
S1PR4O95977 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
S1PR4O95977 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
S1PR4O95977 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
S1PR4O95977 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
S1PR4O95977 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
S1PR4O95977 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
S1PR4O95977 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
S1PR4O95977 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
S1PR4O95977 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
S1PR4O95977 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
S1PR4O95977 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
S1PR4O95977 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
S1PR4O95977 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
S1PR4O95977 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
S1PR4O95977 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
S1PR4O95977 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
S1PR4O95977 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
S1PR4O95977 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
S1PR4O95977 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
S1PR4O95977 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
S1PR4O95977 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
S1PR4O95977 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
S1PR4O95977 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
S1PR4O95977 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
S1PR4O95977 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
S1PR4O95977 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
S1PR4O95977 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
S1PR4O95977 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
S1PR4O95977 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
S1PR4O95977 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
S1PR4O95977 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
S1PR4O95977 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
S1PR4O95977 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
S1PR4O95977 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
S1PR4O95977 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
S1PR4O95977 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
S1PR4O95977 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
S1PR4O95977 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
S1PR4O95977 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
S1PR4O95977 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
S1PR4O95977 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
S1PR4O95977 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
S1PR4O95977 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
S1PR4O95977 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
S1PR4O95977 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
S1PR4O95977 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
S1PR4O95977 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
S1PR4O95977 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
S1PR4O95977 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
S1PR4O95977 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
S1PR4O95977 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
S1PR4O95977 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
S1PR4O95977 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
S1PR4O95977 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
S1PR4O95977 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
S1PR4O95977 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
S1PR4O95977 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
S1PR4O95977 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
S1PR4O95977 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
S1PR4O95977 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
S1PR4O95977 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
S1PR4O95977 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
S1PR4O95977 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
S1PR4O95977 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
S1PR4O95977 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
S1PR4O95977 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
S1PR4O95977 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
S1PR4O95977 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
S1PR4O95977 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
S1PR4O95977 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
S1PR4O95977 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
S1PR4O95977 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
S1PR4O95977 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
S1PR4O95977 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
S1PR4O95977 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
S1PR4O95977 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
S1PR4O95977 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
S1PR4O95977 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
S1PR4O95977 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
S1PR4O95977 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
S1PR4O95977 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
S1PR4O95977 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
S1PR4O95977 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
S1PR4O95977 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
S1PR4O95977 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
S1PR4O95977 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
S1PR4O95977 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
S1PR4O95977 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
S1PR4O95977 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
S1PR4O95977 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
S1PR4O95977 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms