Protein–RNA interactions for Protein: O95741

CPNE6, Copine-6, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6O95741 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPNE6O95741 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPNE6O95741 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPNE6O95741 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPNE6O95741 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPNE6O95741 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPNE6O95741 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPNE6O95741 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPNE6O95741 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPNE6O95741 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPNE6O95741 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPNE6O95741 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPNE6O95741 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPNE6O95741 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPNE6O95741 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CPNE6O95741 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPNE6O95741 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPNE6O95741 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPNE6O95741 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CPNE6O95741 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CPNE6O95741 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPNE6O95741 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPNE6O95741 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPNE6O95741 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPNE6O95741 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPNE6O95741 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPNE6O95741 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPNE6O95741 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CPNE6O95741 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPNE6O95741 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPNE6O95741 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CPNE6O95741 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPNE6O95741 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPNE6O95741 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPNE6O95741 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CPNE6O95741 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CPNE6O95741 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CPNE6O95741 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CPNE6O95741 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CPNE6O95741 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CPNE6O95741 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CPNE6O95741 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CPNE6O95741 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CPNE6O95741 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CPNE6O95741 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CPNE6O95741 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CPNE6O95741 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CPNE6O95741 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CPNE6O95741 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CPNE6O95741 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CPNE6O95741 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CPNE6O95741 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CPNE6O95741 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CPNE6O95741 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CPNE6O95741 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CPNE6O95741 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CPNE6O95741 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CPNE6O95741 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CPNE6O95741 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CPNE6O95741 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CPNE6O95741 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CPNE6O95741 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CPNE6O95741 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CPNE6O95741 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CPNE6O95741 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CPNE6O95741 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CPNE6O95741 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPNE6O95741 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPNE6O95741 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPNE6O95741 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPNE6O95741 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPNE6O95741 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPNE6O95741 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPNE6O95741 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPNE6O95741 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPNE6O95741 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPNE6O95741 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPNE6O95741 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPNE6O95741 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPNE6O95741 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPNE6O95741 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPNE6O95741 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPNE6O95741 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CPNE6O95741 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPNE6O95741 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPNE6O95741 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPNE6O95741 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPNE6O95741 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPNE6O95741 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPNE6O95741 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPNE6O95741 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPNE6O95741 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPNE6O95741 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPNE6O95741 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPNE6O95741 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPNE6O95741 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPNE6O95741 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPNE6O95741 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPNE6O95741 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPNE6O95741 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms