Protein–RNA interactions for Protein: O95427

PIGN, GPI ethanolamine phosphate transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGNO95427 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIGNO95427 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PIGNO95427 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIGNO95427 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIGNO95427 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIGNO95427 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIGNO95427 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIGNO95427 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIGNO95427 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIGNO95427 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PIGNO95427 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIGNO95427 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIGNO95427 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIGNO95427 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIGNO95427 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIGNO95427 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIGNO95427 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIGNO95427 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIGNO95427 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIGNO95427 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PIGNO95427 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PIGNO95427 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PIGNO95427 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PIGNO95427 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PIGNO95427 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PIGNO95427 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PIGNO95427 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIGNO95427 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIGNO95427 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIGNO95427 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIGNO95427 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIGNO95427 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PIGNO95427 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PIGNO95427 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PIGNO95427 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PIGNO95427 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIGNO95427 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIGNO95427 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PIGNO95427 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PIGNO95427 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PIGNO95427 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIGNO95427 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIGNO95427 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIGNO95427 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIGNO95427 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIGNO95427 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIGNO95427 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIGNO95427 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PIGNO95427 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PIGNO95427 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PIGNO95427 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIGNO95427 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIGNO95427 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIGNO95427 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIGNO95427 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PIGNO95427 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIGNO95427 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIGNO95427 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIGNO95427 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PIGNO95427 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIGNO95427 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIGNO95427 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIGNO95427 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIGNO95427 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIGNO95427 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIGNO95427 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIGNO95427 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIGNO95427 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIGNO95427 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIGNO95427 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIGNO95427 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIGNO95427 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIGNO95427 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIGNO95427 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIGNO95427 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIGNO95427 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PIGNO95427 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PIGNO95427 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PIGNO95427 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PIGNO95427 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIGNO95427 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIGNO95427 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIGNO95427 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PIGNO95427 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIGNO95427 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIGNO95427 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIGNO95427 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIGNO95427 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIGNO95427 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIGNO95427 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PIGNO95427 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PIGNO95427 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIGNO95427 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIGNO95427 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PIGNO95427 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIGNO95427 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIGNO95427 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIGNO95427 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIGNO95427 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIGNO95427 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms