Protein–RNA interactions for Protein: O95425

SVIL, Supervillin, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVILO95425 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SVILO95425 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SVILO95425 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SVILO95425 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SVILO95425 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SVILO95425 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SVILO95425 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SVILO95425 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SVILO95425 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SVILO95425 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SVILO95425 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SVILO95425 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SVILO95425 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SVILO95425 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SVILO95425 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SVILO95425 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SVILO95425 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SVILO95425 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SVILO95425 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SVILO95425 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SVILO95425 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SVILO95425 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SVILO95425 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SVILO95425 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SVILO95425 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SVILO95425 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SVILO95425 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SVILO95425 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SVILO95425 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SVILO95425 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SVILO95425 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SVILO95425 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SVILO95425 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SVILO95425 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SVILO95425 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SVILO95425 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SVILO95425 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SVILO95425 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SVILO95425 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SVILO95425 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SVILO95425 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SVILO95425 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SVILO95425 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SVILO95425 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SVILO95425 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SVILO95425 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SVILO95425 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SVILO95425 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SVILO95425 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SVILO95425 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SVILO95425 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SVILO95425 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SVILO95425 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SVILO95425 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SVILO95425 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SVILO95425 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SVILO95425 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SVILO95425 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SVILO95425 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SVILO95425 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SVILO95425 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SVILO95425 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SVILO95425 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SVILO95425 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SVILO95425 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SVILO95425 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SVILO95425 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SVILO95425 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SVILO95425 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SVILO95425 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SVILO95425 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SVILO95425 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SVILO95425 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SVILO95425 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SVILO95425 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SVILO95425 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SVILO95425 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SVILO95425 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SVILO95425 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SVILO95425 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SVILO95425 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SVILO95425 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SVILO95425 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SVILO95425 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SVILO95425 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SVILO95425 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SVILO95425 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SVILO95425 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SVILO95425 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SVILO95425 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SVILO95425 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SVILO95425 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SVILO95425 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SVILO95425 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SVILO95425 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SVILO95425 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SVILO95425 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SVILO95425 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SVILO95425 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SVILO95425 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms