Protein–RNA interactions for Protein: O95388

WISP1, WNT1-inducible-signaling pathway protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WISP1O95388 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
WISP1O95388 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
WISP1O95388 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
WISP1O95388 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WISP1O95388 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WISP1O95388 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WISP1O95388 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
WISP1O95388 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WISP1O95388 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WISP1O95388 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
WISP1O95388 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WISP1O95388 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WISP1O95388 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WISP1O95388 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
WISP1O95388 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
WISP1O95388 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WISP1O95388 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WISP1O95388 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WISP1O95388 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
WISP1O95388 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
WISP1O95388 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
WISP1O95388 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
WISP1O95388 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
WISP1O95388 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
WISP1O95388 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
WISP1O95388 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
WISP1O95388 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WISP1O95388 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
WISP1O95388 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
WISP1O95388 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
WISP1O95388 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WISP1O95388 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
WISP1O95388 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WISP1O95388 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WISP1O95388 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WISP1O95388 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
WISP1O95388 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WISP1O95388 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
WISP1O95388 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WISP1O95388 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
WISP1O95388 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WISP1O95388 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WISP1O95388 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
WISP1O95388 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
WISP1O95388 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WISP1O95388 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WISP1O95388 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WISP1O95388 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
WISP1O95388 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WISP1O95388 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WISP1O95388 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
WISP1O95388 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
WISP1O95388 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
WISP1O95388 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
WISP1O95388 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WISP1O95388 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WISP1O95388 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WISP1O95388 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WISP1O95388 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WISP1O95388 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WISP1O95388 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WISP1O95388 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WISP1O95388 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WISP1O95388 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WISP1O95388 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WISP1O95388 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WISP1O95388 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
WISP1O95388 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WISP1O95388 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WISP1O95388 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
WISP1O95388 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WISP1O95388 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
WISP1O95388 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WISP1O95388 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WISP1O95388 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WISP1O95388 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WISP1O95388 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
WISP1O95388 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
WISP1O95388 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WISP1O95388 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WISP1O95388 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WISP1O95388 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
WISP1O95388 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
WISP1O95388 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
WISP1O95388 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
WISP1O95388 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
WISP1O95388 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
WISP1O95388 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WISP1O95388 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
WISP1O95388 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
WISP1O95388 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WISP1O95388 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
WISP1O95388 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
WISP1O95388 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
WISP1O95388 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
WISP1O95388 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
WISP1O95388 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
WISP1O95388 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
WISP1O95388 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
WISP1O95388 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms