Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KIF4AO95239 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KIF4AO95239 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KIF4AO95239 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KIF4AO95239 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KIF4AO95239 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
KIF4AO95239 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
KIF4AO95239 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
KIF4AO95239 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
KIF4AO95239 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
KIF4AO95239 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
KIF4AO95239 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KIF4AO95239 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KIF4AO95239 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KIF4AO95239 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KIF4AO95239 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KIF4AO95239 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KIF4AO95239 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
KIF4AO95239 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KIF4AO95239 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KIF4AO95239 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KIF4AO95239 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KIF4AO95239 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIF4AO95239 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIF4AO95239 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
KIF4AO95239 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KIF4AO95239 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KIF4AO95239 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KIF4AO95239 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KIF4AO95239 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KIF4AO95239 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KIF4AO95239 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KIF4AO95239 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
KIF4AO95239 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KIF4AO95239 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KIF4AO95239 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KIF4AO95239 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KIF4AO95239 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
KIF4AO95239 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KIF4AO95239 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KIF4AO95239 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KIF4AO95239 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
KIF4AO95239 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
KIF4AO95239 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KIF4AO95239 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KIF4AO95239 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KIF4AO95239 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KIF4AO95239 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KIF4AO95239 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KIF4AO95239 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KIF4AO95239 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KIF4AO95239 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KIF4AO95239 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KIF4AO95239 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KIF4AO95239 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KIF4AO95239 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KIF4AO95239 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KIF4AO95239 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KIF4AO95239 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KIF4AO95239 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KIF4AO95239 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KIF4AO95239 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIF4AO95239 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KIF4AO95239 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
KIF4AO95239 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIF4AO95239 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIF4AO95239 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIF4AO95239 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
KIF4AO95239 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIF4AO95239 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIF4AO95239 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIF4AO95239 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIF4AO95239 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIF4AO95239 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIF4AO95239 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIF4AO95239 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
KIF4AO95239 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIF4AO95239 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIF4AO95239 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIF4AO95239 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
KIF4AO95239 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIF4AO95239 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIF4AO95239 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIF4AO95239 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIF4AO95239 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KIF4AO95239 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KIF4AO95239 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KIF4AO95239 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KIF4AO95239 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KIF4AO95239 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KIF4AO95239 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KIF4AO95239 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
KIF4AO95239 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
KIF4AO95239 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KIF4AO95239 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KIF4AO95239 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KIF4AO95239 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KIF4AO95239 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KIF4AO95239 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KIF4AO95239 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms