Protein–RNA interactions for Protein: O95231

VENTX, Homeobox protein VENTX, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VENTXO95231 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VENTXO95231 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
VENTXO95231 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VENTXO95231 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VENTXO95231 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VENTXO95231 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VENTXO95231 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VENTXO95231 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VENTXO95231 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VENTXO95231 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VENTXO95231 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VENTXO95231 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VENTXO95231 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VENTXO95231 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VENTXO95231 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VENTXO95231 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VENTXO95231 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VENTXO95231 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VENTXO95231 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VENTXO95231 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VENTXO95231 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VENTXO95231 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VENTXO95231 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VENTXO95231 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VENTXO95231 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VENTXO95231 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VENTXO95231 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VENTXO95231 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VENTXO95231 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VENTXO95231 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VENTXO95231 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VENTXO95231 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VENTXO95231 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VENTXO95231 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VENTXO95231 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VENTXO95231 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VENTXO95231 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VENTXO95231 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VENTXO95231 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VENTXO95231 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VENTXO95231 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VENTXO95231 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VENTXO95231 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VENTXO95231 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VENTXO95231 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VENTXO95231 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VENTXO95231 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VENTXO95231 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VENTXO95231 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VENTXO95231 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VENTXO95231 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VENTXO95231 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VENTXO95231 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VENTXO95231 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VENTXO95231 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VENTXO95231 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VENTXO95231 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VENTXO95231 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VENTXO95231 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VENTXO95231 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VENTXO95231 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VENTXO95231 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VENTXO95231 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VENTXO95231 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VENTXO95231 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VENTXO95231 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VENTXO95231 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VENTXO95231 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VENTXO95231 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VENTXO95231 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VENTXO95231 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VENTXO95231 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VENTXO95231 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VENTXO95231 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VENTXO95231 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VENTXO95231 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VENTXO95231 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VENTXO95231 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VENTXO95231 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VENTXO95231 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VENTXO95231 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VENTXO95231 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VENTXO95231 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VENTXO95231 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VENTXO95231 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VENTXO95231 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VENTXO95231 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VENTXO95231 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VENTXO95231 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VENTXO95231 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VENTXO95231 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VENTXO95231 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VENTXO95231 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VENTXO95231 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VENTXO95231 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VENTXO95231 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VENTXO95231 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VENTXO95231 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VENTXO95231 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VENTXO95231 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms