Protein–RNA interactions for Protein: O94967

WDR47, WD repeat-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR47O94967 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
WDR47O94967 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
WDR47O94967 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
WDR47O94967 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR47O94967 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
WDR47O94967 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
WDR47O94967 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
WDR47O94967 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
WDR47O94967 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
WDR47O94967 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
WDR47O94967 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
WDR47O94967 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
WDR47O94967 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
WDR47O94967 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
WDR47O94967 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
WDR47O94967 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
WDR47O94967 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
WDR47O94967 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
WDR47O94967 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
WDR47O94967 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
WDR47O94967 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
WDR47O94967 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
WDR47O94967 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
WDR47O94967 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
WDR47O94967 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
WDR47O94967 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
WDR47O94967 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
WDR47O94967 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
WDR47O94967 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
WDR47O94967 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
WDR47O94967 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
WDR47O94967 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
WDR47O94967 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
WDR47O94967 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
WDR47O94967 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
WDR47O94967 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
WDR47O94967 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
WDR47O94967 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
WDR47O94967 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
WDR47O94967 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
WDR47O94967 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
WDR47O94967 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR47O94967 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR47O94967 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR47O94967 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR47O94967 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR47O94967 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR47O94967 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR47O94967 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR47O94967 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR47O94967 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR47O94967 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
WDR47O94967 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDR47O94967 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDR47O94967 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDR47O94967 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR47O94967 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR47O94967 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR47O94967 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
WDR47O94967 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
WDR47O94967 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
WDR47O94967 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
WDR47O94967 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
WDR47O94967 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
WDR47O94967 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
WDR47O94967 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
WDR47O94967 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
WDR47O94967 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
WDR47O94967 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
WDR47O94967 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR47O94967 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR47O94967 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR47O94967 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR47O94967 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR47O94967 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR47O94967 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR47O94967 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR47O94967 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR47O94967 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR47O94967 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
WDR47O94967 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
WDR47O94967 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
WDR47O94967 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
WDR47O94967 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
WDR47O94967 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
WDR47O94967 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
WDR47O94967 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR47O94967 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR47O94967 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR47O94967 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR47O94967 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR47O94967 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR47O94967 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR47O94967 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR47O94967 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR47O94967 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR47O94967 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR47O94967 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR47O94967 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR47O94967 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms