Protein–RNA interactions for Protein: O94868

FCHSD2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHSD2O94868 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
FCHSD2O94868 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
FCHSD2O94868 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
FCHSD2O94868 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
FCHSD2O94868 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
FCHSD2O94868 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
FCHSD2O94868 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
FCHSD2O94868 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
FCHSD2O94868 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
FCHSD2O94868 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
FCHSD2O94868 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
FCHSD2O94868 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
FCHSD2O94868 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
FCHSD2O94868 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
FCHSD2O94868 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
FCHSD2O94868 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
FCHSD2O94868 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
FCHSD2O94868 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
FCHSD2O94868 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
FCHSD2O94868 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
FCHSD2O94868 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
FCHSD2O94868 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
FCHSD2O94868 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
FCHSD2O94868 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
FCHSD2O94868 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
FCHSD2O94868 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
FCHSD2O94868 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
FCHSD2O94868 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
FCHSD2O94868 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
FCHSD2O94868 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
FCHSD2O94868 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
FCHSD2O94868 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
FCHSD2O94868 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
FCHSD2O94868 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
FCHSD2O94868 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
FCHSD2O94868 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
FCHSD2O94868 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
FCHSD2O94868 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
FCHSD2O94868 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
FCHSD2O94868 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC35.9■■■■□ 3.34
FCHSD2O94868 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
FCHSD2O94868 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
FCHSD2O94868 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
FCHSD2O94868 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
FCHSD2O94868 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
FCHSD2O94868 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
FCHSD2O94868 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
FCHSD2O94868 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
FCHSD2O94868 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
FCHSD2O94868 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
FCHSD2O94868 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
FCHSD2O94868 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
FCHSD2O94868 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
FCHSD2O94868 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
FCHSD2O94868 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
FCHSD2O94868 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
FCHSD2O94868 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
FCHSD2O94868 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
FCHSD2O94868 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
FCHSD2O94868 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
FCHSD2O94868 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
FCHSD2O94868 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
FCHSD2O94868 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
FCHSD2O94868 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
FCHSD2O94868 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
FCHSD2O94868 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
FCHSD2O94868 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
FCHSD2O94868 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
FCHSD2O94868 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
FCHSD2O94868 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
FCHSD2O94868 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
FCHSD2O94868 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
FCHSD2O94868 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
FCHSD2O94868 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
FCHSD2O94868 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
FCHSD2O94868 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
FCHSD2O94868 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
FCHSD2O94868 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
FCHSD2O94868 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
FCHSD2O94868 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
FCHSD2O94868 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
FCHSD2O94868 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
FCHSD2O94868 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
FCHSD2O94868 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
FCHSD2O94868 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
FCHSD2O94868 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
FCHSD2O94868 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
FCHSD2O94868 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
FCHSD2O94868 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
FCHSD2O94868 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
FCHSD2O94868 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
FCHSD2O94868 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
FCHSD2O94868 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
FCHSD2O94868 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
FCHSD2O94868 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
FCHSD2O94868 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
FCHSD2O94868 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
FCHSD2O94868 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
FCHSD2O94868 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
FCHSD2O94868 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms