Protein–RNA interactions for Protein: O94822

LTN1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, humanhuman

Predictions only

Length 1,766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTN1O94822 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
LTN1O94822 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
LTN1O94822 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
LTN1O94822 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
LTN1O94822 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
LTN1O94822 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
LTN1O94822 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
LTN1O94822 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
LTN1O94822 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
LTN1O94822 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
LTN1O94822 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
LTN1O94822 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
LTN1O94822 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
LTN1O94822 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
LTN1O94822 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
LTN1O94822 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
LTN1O94822 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
LTN1O94822 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
LTN1O94822 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
LTN1O94822 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
LTN1O94822 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
LTN1O94822 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
LTN1O94822 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
LTN1O94822 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
LTN1O94822 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
LTN1O94822 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
LTN1O94822 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
LTN1O94822 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
LTN1O94822 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
LTN1O94822 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
LTN1O94822 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.74■■■■□ 3.47
LTN1O94822 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
LTN1O94822 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
LTN1O94822 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
LTN1O94822 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
LTN1O94822 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
LTN1O94822 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
LTN1O94822 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
LTN1O94822 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
LTN1O94822 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
LTN1O94822 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
LTN1O94822 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
LTN1O94822 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
LTN1O94822 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
LTN1O94822 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
LTN1O94822 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.46
LTN1O94822 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
LTN1O94822 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
LTN1O94822 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
LTN1O94822 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
LTN1O94822 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
LTN1O94822 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
LTN1O94822 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
LTN1O94822 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
LTN1O94822 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
LTN1O94822 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.56■■■■□ 3.44
LTN1O94822 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
LTN1O94822 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
LTN1O94822 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
LTN1O94822 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
LTN1O94822 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
LTN1O94822 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
LTN1O94822 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
LTN1O94822 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
LTN1O94822 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
LTN1O94822 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
LTN1O94822 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
LTN1O94822 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
LTN1O94822 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
LTN1O94822 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
LTN1O94822 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
LTN1O94822 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
LTN1O94822 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
LTN1O94822 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
LTN1O94822 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
LTN1O94822 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
LTN1O94822 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
LTN1O94822 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
LTN1O94822 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
LTN1O94822 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
LTN1O94822 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
LTN1O94822 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
LTN1O94822 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
LTN1O94822 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
LTN1O94822 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
LTN1O94822 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
LTN1O94822 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
LTN1O94822 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
LTN1O94822 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
LTN1O94822 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
LTN1O94822 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
LTN1O94822 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
LTN1O94822 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
LTN1O94822 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
LTN1O94822 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
LTN1O94822 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
LTN1O94822 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
LTN1O94822 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
LTN1O94822 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
LTN1O94822 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms