Protein–RNA interactions for Protein: O75923

DYSF, Dysferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,080 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSFO75923 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
DYSFO75923 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DYSFO75923 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DYSFO75923 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYSFO75923 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYSFO75923 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYSFO75923 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DYSFO75923 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DYSFO75923 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DYSFO75923 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DYSFO75923 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DYSFO75923 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DYSFO75923 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DYSFO75923 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DYSFO75923 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DYSFO75923 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DYSFO75923 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DYSFO75923 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DYSFO75923 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DYSFO75923 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DYSFO75923 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DYSFO75923 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DYSFO75923 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DYSFO75923 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DYSFO75923 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYSFO75923 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DYSFO75923 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DYSFO75923 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DYSFO75923 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYSFO75923 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYSFO75923 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYSFO75923 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYSFO75923 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYSFO75923 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYSFO75923 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYSFO75923 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYSFO75923 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYSFO75923 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYSFO75923 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DYSFO75923 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYSFO75923 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYSFO75923 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYSFO75923 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYSFO75923 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYSFO75923 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DYSFO75923 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYSFO75923 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYSFO75923 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
DYSFO75923 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYSFO75923 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYSFO75923 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYSFO75923 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYSFO75923 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYSFO75923 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DYSFO75923 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DYSFO75923 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DYSFO75923 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DYSFO75923 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DYSFO75923 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYSFO75923 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYSFO75923 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYSFO75923 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYSFO75923 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYSFO75923 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYSFO75923 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYSFO75923 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DYSFO75923 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DYSFO75923 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DYSFO75923 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DYSFO75923 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DYSFO75923 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DYSFO75923 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DYSFO75923 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DYSFO75923 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DYSFO75923 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DYSFO75923 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DYSFO75923 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DYSFO75923 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DYSFO75923 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DYSFO75923 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DYSFO75923 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DYSFO75923 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DYSFO75923 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DYSFO75923 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DYSFO75923 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DYSFO75923 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DYSFO75923 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DYSFO75923 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DYSFO75923 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DYSFO75923 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DYSFO75923 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DYSFO75923 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DYSFO75923 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DYSFO75923 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DYSFO75923 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DYSFO75923 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DYSFO75923 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DYSFO75923 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DYSFO75923 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DYSFO75923 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms