Protein–RNA interactions for Protein: O75901

RASSF9, Ras association domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF9O75901 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RASSF9O75901 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RASSF9O75901 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RASSF9O75901 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RASSF9O75901 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RASSF9O75901 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RASSF9O75901 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RASSF9O75901 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RASSF9O75901 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RASSF9O75901 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RASSF9O75901 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RASSF9O75901 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RASSF9O75901 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RASSF9O75901 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RASSF9O75901 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RASSF9O75901 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RASSF9O75901 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RASSF9O75901 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RASSF9O75901 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RASSF9O75901 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RASSF9O75901 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RASSF9O75901 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RASSF9O75901 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RASSF9O75901 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RASSF9O75901 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RASSF9O75901 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RASSF9O75901 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RASSF9O75901 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RASSF9O75901 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RASSF9O75901 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RASSF9O75901 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RASSF9O75901 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RASSF9O75901 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RASSF9O75901 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RASSF9O75901 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RASSF9O75901 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RASSF9O75901 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RASSF9O75901 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RASSF9O75901 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RASSF9O75901 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RASSF9O75901 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RASSF9O75901 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RASSF9O75901 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RASSF9O75901 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RASSF9O75901 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RASSF9O75901 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RASSF9O75901 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RASSF9O75901 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RASSF9O75901 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RASSF9O75901 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RASSF9O75901 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RASSF9O75901 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RASSF9O75901 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RASSF9O75901 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RASSF9O75901 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RASSF9O75901 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RASSF9O75901 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RASSF9O75901 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RASSF9O75901 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RASSF9O75901 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RASSF9O75901 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RASSF9O75901 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RASSF9O75901 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms