Protein–RNA interactions for Protein: O75900

MMP23A, Matrix metalloproteinase-23, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP23AO75900 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP23AO75900 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP23AO75900 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP23AO75900 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP23AO75900 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP23AO75900 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP23AO75900 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP23AO75900 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP23AO75900 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP23AO75900 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP23AO75900 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP23AO75900 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP23AO75900 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP23AO75900 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP23AO75900 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP23AO75900 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP23AO75900 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP23AO75900 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP23AO75900 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP23AO75900 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP23AO75900 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP23AO75900 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP23AO75900 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP23AO75900 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP23AO75900 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP23AO75900 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP23AO75900 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP23AO75900 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP23AO75900 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP23AO75900 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP23AO75900 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP23AO75900 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP23AO75900 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP23AO75900 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP23AO75900 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP23AO75900 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP23AO75900 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP23AO75900 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP23AO75900 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP23AO75900 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP23AO75900 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP23AO75900 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP23AO75900 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP23AO75900 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP23AO75900 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP23AO75900 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP23AO75900 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP23AO75900 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP23AO75900 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP23AO75900 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP23AO75900 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP23AO75900 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP23AO75900 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MMP23AO75900 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP23AO75900 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP23AO75900 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP23AO75900 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP23AO75900 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP23AO75900 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP23AO75900 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP23AO75900 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP23AO75900 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP23AO75900 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP23AO75900 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP23AO75900 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP23AO75900 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP23AO75900 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP23AO75900 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP23AO75900 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP23AO75900 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP23AO75900 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP23AO75900 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP23AO75900 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MMP23AO75900 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP23AO75900 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP23AO75900 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP23AO75900 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP23AO75900 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP23AO75900 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP23AO75900 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP23AO75900 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP23AO75900 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP23AO75900 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP23AO75900 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP23AO75900 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP23AO75900 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP23AO75900 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP23AO75900 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP23AO75900 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP23AO75900 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP23AO75900 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP23AO75900 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP23AO75900 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP23AO75900 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP23AO75900 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP23AO75900 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP23AO75900 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP23AO75900 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP23AO75900 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP23AO75900 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms