Protein–RNA interactions for Protein: O75818

RPP40, Ribonuclease P protein subunit p40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPP40O75818 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPP40O75818 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPP40O75818 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RPP40O75818 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPP40O75818 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPP40O75818 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPP40O75818 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPP40O75818 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RPP40O75818 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPP40O75818 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPP40O75818 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPP40O75818 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPP40O75818 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPP40O75818 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPP40O75818 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPP40O75818 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPP40O75818 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPP40O75818 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPP40O75818 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPP40O75818 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RPP40O75818 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPP40O75818 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RPP40O75818 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPP40O75818 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RPP40O75818 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPP40O75818 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPP40O75818 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPP40O75818 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPP40O75818 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPP40O75818 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPP40O75818 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPP40O75818 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPP40O75818 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPP40O75818 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPP40O75818 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPP40O75818 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPP40O75818 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPP40O75818 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPP40O75818 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPP40O75818 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPP40O75818 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPP40O75818 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPP40O75818 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPP40O75818 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPP40O75818 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPP40O75818 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPP40O75818 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPP40O75818 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPP40O75818 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPP40O75818 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPP40O75818 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPP40O75818 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPP40O75818 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPP40O75818 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPP40O75818 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPP40O75818 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPP40O75818 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPP40O75818 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPP40O75818 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPP40O75818 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPP40O75818 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPP40O75818 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPP40O75818 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPP40O75818 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPP40O75818 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPP40O75818 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RPP40O75818 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPP40O75818 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPP40O75818 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPP40O75818 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPP40O75818 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPP40O75818 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPP40O75818 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPP40O75818 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPP40O75818 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPP40O75818 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPP40O75818 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPP40O75818 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPP40O75818 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPP40O75818 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPP40O75818 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPP40O75818 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPP40O75818 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPP40O75818 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPP40O75818 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPP40O75818 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RPP40O75818 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RPP40O75818 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RPP40O75818 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RPP40O75818 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RPP40O75818 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPP40O75818 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RPP40O75818 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RPP40O75818 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RPP40O75818 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RPP40O75818 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPP40O75818 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RPP40O75818 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPP40O75818 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPP40O75818 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.1 ms