Protein–RNA interactions for Protein: O75264

SMIM24, Small integral membrane protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM24O75264 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM24O75264 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM24O75264 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMIM24O75264 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMIM24O75264 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMIM24O75264 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMIM24O75264 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMIM24O75264 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMIM24O75264 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMIM24O75264 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMIM24O75264 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMIM24O75264 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMIM24O75264 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMIM24O75264 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMIM24O75264 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMIM24O75264 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMIM24O75264 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM24O75264 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM24O75264 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM24O75264 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM24O75264 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM24O75264 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMIM24O75264 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMIM24O75264 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMIM24O75264 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMIM24O75264 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMIM24O75264 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMIM24O75264 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMIM24O75264 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMIM24O75264 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SMIM24O75264 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMIM24O75264 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMIM24O75264 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMIM24O75264 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMIM24O75264 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMIM24O75264 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMIM24O75264 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMIM24O75264 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMIM24O75264 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMIM24O75264 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMIM24O75264 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMIM24O75264 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMIM24O75264 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMIM24O75264 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMIM24O75264 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMIM24O75264 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMIM24O75264 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMIM24O75264 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SMIM24O75264 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMIM24O75264 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMIM24O75264 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM24O75264 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM24O75264 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM24O75264 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM24O75264 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMIM24O75264 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMIM24O75264 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMIM24O75264 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMIM24O75264 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMIM24O75264 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMIM24O75264 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMIM24O75264 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMIM24O75264 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMIM24O75264 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMIM24O75264 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMIM24O75264 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMIM24O75264 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMIM24O75264 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMIM24O75264 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMIM24O75264 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMIM24O75264 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMIM24O75264 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMIM24O75264 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM24O75264 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM24O75264 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM24O75264 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMIM24O75264 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMIM24O75264 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMIM24O75264 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMIM24O75264 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMIM24O75264 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMIM24O75264 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMIM24O75264 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM24O75264 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM24O75264 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM24O75264 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMIM24O75264 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMIM24O75264 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMIM24O75264 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMIM24O75264 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMIM24O75264 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMIM24O75264 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMIM24O75264 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMIM24O75264 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SMIM24O75264 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMIM24O75264 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMIM24O75264 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM24O75264 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM24O75264 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM24O75264 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms