Protein–RNA interactions for Protein: O75175

CNOT3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3O75175 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNOT3O75175 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNOT3O75175 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNOT3O75175 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNOT3O75175 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNOT3O75175 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNOT3O75175 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CNOT3O75175 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNOT3O75175 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNOT3O75175 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNOT3O75175 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNOT3O75175 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNOT3O75175 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNOT3O75175 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNOT3O75175 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNOT3O75175 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNOT3O75175 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNOT3O75175 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNOT3O75175 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNOT3O75175 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNOT3O75175 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNOT3O75175 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNOT3O75175 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNOT3O75175 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNOT3O75175 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNOT3O75175 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNOT3O75175 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNOT3O75175 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNOT3O75175 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CNOT3O75175 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNOT3O75175 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CNOT3O75175 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNOT3O75175 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNOT3O75175 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNOT3O75175 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNOT3O75175 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNOT3O75175 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNOT3O75175 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNOT3O75175 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CNOT3O75175 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNOT3O75175 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNOT3O75175 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNOT3O75175 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNOT3O75175 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNOT3O75175 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNOT3O75175 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNOT3O75175 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNOT3O75175 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNOT3O75175 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNOT3O75175 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CNOT3O75175 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNOT3O75175 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNOT3O75175 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CNOT3O75175 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNOT3O75175 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CNOT3O75175 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNOT3O75175 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNOT3O75175 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNOT3O75175 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNOT3O75175 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNOT3O75175 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNOT3O75175 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNOT3O75175 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNOT3O75175 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNOT3O75175 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT3O75175 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT3O75175 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT3O75175 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT3O75175 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT3O75175 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT3O75175 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT3O75175 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT3O75175 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT3O75175 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT3O75175 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNOT3O75175 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNOT3O75175 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNOT3O75175 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNOT3O75175 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNOT3O75175 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNOT3O75175 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CNOT3O75175 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNOT3O75175 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNOT3O75175 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNOT3O75175 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNOT3O75175 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNOT3O75175 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNOT3O75175 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNOT3O75175 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNOT3O75175 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CNOT3O75175 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNOT3O75175 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNOT3O75175 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNOT3O75175 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNOT3O75175 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNOT3O75175 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNOT3O75175 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNOT3O75175 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNOT3O75175 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNOT3O75175 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms