Protein–RNA interactions for Protein: O75167

PHACTR2, Phosphatase and actin regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR2O75167 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PHACTR2O75167 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PHACTR2O75167 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PHACTR2O75167 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PHACTR2O75167 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PHACTR2O75167 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PHACTR2O75167 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PHACTR2O75167 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PHACTR2O75167 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PHACTR2O75167 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PHACTR2O75167 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PHACTR2O75167 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PHACTR2O75167 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PHACTR2O75167 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PHACTR2O75167 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PHACTR2O75167 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHACTR2O75167 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHACTR2O75167 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHACTR2O75167 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PHACTR2O75167 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PHACTR2O75167 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PHACTR2O75167 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PHACTR2O75167 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PHACTR2O75167 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PHACTR2O75167 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PHACTR2O75167 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PHACTR2O75167 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PHACTR2O75167 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PHACTR2O75167 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PHACTR2O75167 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PHACTR2O75167 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PHACTR2O75167 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PHACTR2O75167 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PHACTR2O75167 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PHACTR2O75167 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHACTR2O75167 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHACTR2O75167 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PHACTR2O75167 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PHACTR2O75167 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHACTR2O75167 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHACTR2O75167 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PHACTR2O75167 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHACTR2O75167 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHACTR2O75167 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PHACTR2O75167 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PHACTR2O75167 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PHACTR2O75167 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHACTR2O75167 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHACTR2O75167 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHACTR2O75167 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHACTR2O75167 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHACTR2O75167 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHACTR2O75167 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHACTR2O75167 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHACTR2O75167 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PHACTR2O75167 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHACTR2O75167 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHACTR2O75167 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHACTR2O75167 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHACTR2O75167 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHACTR2O75167 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PHACTR2O75167 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PHACTR2O75167 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PHACTR2O75167 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PHACTR2O75167 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PHACTR2O75167 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PHACTR2O75167 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PHACTR2O75167 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PHACTR2O75167 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHACTR2O75167 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PHACTR2O75167 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PHACTR2O75167 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PHACTR2O75167 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PHACTR2O75167 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PHACTR2O75167 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PHACTR2O75167 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHACTR2O75167 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHACTR2O75167 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHACTR2O75167 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHACTR2O75167 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PHACTR2O75167 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PHACTR2O75167 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PHACTR2O75167 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PHACTR2O75167 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PHACTR2O75167 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PHACTR2O75167 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PHACTR2O75167 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHACTR2O75167 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHACTR2O75167 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHACTR2O75167 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHACTR2O75167 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PHACTR2O75167 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PHACTR2O75167 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PHACTR2O75167 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PHACTR2O75167 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PHACTR2O75167 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PHACTR2O75167 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHACTR2O75167 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHACTR2O75167 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHACTR2O75167 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms