Protein–RNA interactions for Protein: O60930

RNASEH1, Ribonuclease H1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASEH1O60930 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNASEH1O60930 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNASEH1O60930 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNASEH1O60930 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNASEH1O60930 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNASEH1O60930 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNASEH1O60930 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNASEH1O60930 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RNASEH1O60930 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNASEH1O60930 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNASEH1O60930 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNASEH1O60930 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNASEH1O60930 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNASEH1O60930 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNASEH1O60930 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNASEH1O60930 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNASEH1O60930 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNASEH1O60930 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RNASEH1O60930 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNASEH1O60930 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNASEH1O60930 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNASEH1O60930 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNASEH1O60930 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNASEH1O60930 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNASEH1O60930 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNASEH1O60930 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNASEH1O60930 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNASEH1O60930 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNASEH1O60930 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RNASEH1O60930 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNASEH1O60930 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNASEH1O60930 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNASEH1O60930 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
RNASEH1O60930 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNASEH1O60930 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNASEH1O60930 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNASEH1O60930 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNASEH1O60930 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RNASEH1O60930 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RNASEH1O60930 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNASEH1O60930 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNASEH1O60930 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNASEH1O60930 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNASEH1O60930 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNASEH1O60930 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNASEH1O60930 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNASEH1O60930 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RNASEH1O60930 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNASEH1O60930 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNASEH1O60930 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNASEH1O60930 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNASEH1O60930 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNASEH1O60930 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNASEH1O60930 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNASEH1O60930 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNASEH1O60930 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNASEH1O60930 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNASEH1O60930 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNASEH1O60930 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RNASEH1O60930 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNASEH1O60930 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNASEH1O60930 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNASEH1O60930 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNASEH1O60930 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNASEH1O60930 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RNASEH1O60930 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNASEH1O60930 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNASEH1O60930 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNASEH1O60930 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNASEH1O60930 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNASEH1O60930 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNASEH1O60930 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNASEH1O60930 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNASEH1O60930 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNASEH1O60930 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNASEH1O60930 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNASEH1O60930 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNASEH1O60930 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNASEH1O60930 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNASEH1O60930 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNASEH1O60930 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNASEH1O60930 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNASEH1O60930 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNASEH1O60930 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNASEH1O60930 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNASEH1O60930 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNASEH1O60930 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNASEH1O60930 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNASEH1O60930 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNASEH1O60930 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNASEH1O60930 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNASEH1O60930 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RNASEH1O60930 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNASEH1O60930 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNASEH1O60930 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNASEH1O60930 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNASEH1O60930 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNASEH1O60930 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNASEH1O60930 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNASEH1O60930 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms