Protein–RNA interactions for Protein: O60906

SMPD2, Sphingomyelin phosphodiesterase 2, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD2O60906 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMPD2O60906 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMPD2O60906 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMPD2O60906 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SMPD2O60906 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMPD2O60906 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMPD2O60906 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMPD2O60906 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMPD2O60906 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMPD2O60906 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMPD2O60906 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMPD2O60906 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMPD2O60906 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMPD2O60906 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMPD2O60906 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMPD2O60906 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMPD2O60906 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMPD2O60906 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMPD2O60906 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMPD2O60906 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMPD2O60906 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SMPD2O60906 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMPD2O60906 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD2O60906 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD2O60906 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD2O60906 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPD2O60906 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMPD2O60906 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMPD2O60906 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMPD2O60906 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMPD2O60906 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMPD2O60906 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMPD2O60906 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SMPD2O60906 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMPD2O60906 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMPD2O60906 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMPD2O60906 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMPD2O60906 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMPD2O60906 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPD2O60906 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPD2O60906 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD2O60906 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPD2O60906 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPD2O60906 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPD2O60906 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPD2O60906 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPD2O60906 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD2O60906 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD2O60906 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMPD2O60906 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMPD2O60906 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMPD2O60906 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPD2O60906 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPD2O60906 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPD2O60906 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPD2O60906 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPD2O60906 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPD2O60906 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPD2O60906 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPD2O60906 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPD2O60906 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMPD2O60906 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMPD2O60906 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMPD2O60906 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMPD2O60906 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMPD2O60906 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMPD2O60906 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMPD2O60906 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMPD2O60906 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMPD2O60906 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPD2O60906 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPD2O60906 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPD2O60906 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMPD2O60906 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPD2O60906 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPD2O60906 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPD2O60906 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPD2O60906 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPD2O60906 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPD2O60906 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPD2O60906 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD2O60906 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD2O60906 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD2O60906 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD2O60906 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD2O60906 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPD2O60906 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMPD2O60906 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMPD2O60906 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMPD2O60906 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD2O60906 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD2O60906 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD2O60906 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD2O60906 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD2O60906 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD2O60906 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD2O60906 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD2O60906 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMPD2O60906 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMPD2O60906 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms