Protein–RNA interactions for Protein: O60890

OPHN1, Oligophrenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPHN1O60890 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
OPHN1O60890 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
OPHN1O60890 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
OPHN1O60890 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
OPHN1O60890 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
OPHN1O60890 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
OPHN1O60890 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
OPHN1O60890 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
OPHN1O60890 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
OPHN1O60890 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
OPHN1O60890 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
OPHN1O60890 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
OPHN1O60890 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
OPHN1O60890 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
OPHN1O60890 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
OPHN1O60890 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
OPHN1O60890 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
OPHN1O60890 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
OPHN1O60890 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
OPHN1O60890 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
OPHN1O60890 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
OPHN1O60890 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
OPHN1O60890 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
OPHN1O60890 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
OPHN1O60890 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
OPHN1O60890 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
OPHN1O60890 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
OPHN1O60890 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
OPHN1O60890 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
OPHN1O60890 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
OPHN1O60890 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
OPHN1O60890 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
OPHN1O60890 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
OPHN1O60890 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
OPHN1O60890 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
OPHN1O60890 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
OPHN1O60890 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
OPHN1O60890 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
OPHN1O60890 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
OPHN1O60890 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
OPHN1O60890 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
OPHN1O60890 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
OPHN1O60890 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
OPHN1O60890 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
OPHN1O60890 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
OPHN1O60890 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
OPHN1O60890 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
OPHN1O60890 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
OPHN1O60890 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
OPHN1O60890 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
OPHN1O60890 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
OPHN1O60890 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
OPHN1O60890 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
OPHN1O60890 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
OPHN1O60890 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
OPHN1O60890 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
OPHN1O60890 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
OPHN1O60890 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
OPHN1O60890 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
OPHN1O60890 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
OPHN1O60890 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
OPHN1O60890 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
OPHN1O60890 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
OPHN1O60890 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
OPHN1O60890 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
OPHN1O60890 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
OPHN1O60890 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
OPHN1O60890 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
OPHN1O60890 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
OPHN1O60890 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
OPHN1O60890 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
OPHN1O60890 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
OPHN1O60890 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
OPHN1O60890 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
OPHN1O60890 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
OPHN1O60890 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
OPHN1O60890 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
OPHN1O60890 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
OPHN1O60890 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
OPHN1O60890 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
OPHN1O60890 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
OPHN1O60890 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
OPHN1O60890 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
OPHN1O60890 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
OPHN1O60890 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
OPHN1O60890 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
OPHN1O60890 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
OPHN1O60890 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
OPHN1O60890 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
OPHN1O60890 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
OPHN1O60890 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
OPHN1O60890 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
OPHN1O60890 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
OPHN1O60890 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
OPHN1O60890 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
OPHN1O60890 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
OPHN1O60890 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
OPHN1O60890 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
OPHN1O60890 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
OPHN1O60890 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms