Protein–RNA interactions for Protein: O60813

PRAMEF11, PRAME family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF11O60813 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PRAMEF11O60813 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRAMEF11O60813 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRAMEF11O60813 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRAMEF11O60813 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRAMEF11O60813 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRAMEF11O60813 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRAMEF11O60813 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRAMEF11O60813 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAMEF11O60813 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAMEF11O60813 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAMEF11O60813 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRAMEF11O60813 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRAMEF11O60813 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRAMEF11O60813 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAMEF11O60813 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAMEF11O60813 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAMEF11O60813 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAMEF11O60813 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAMEF11O60813 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAMEF11O60813 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRAMEF11O60813 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAMEF11O60813 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAMEF11O60813 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAMEF11O60813 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAMEF11O60813 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAMEF11O60813 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAMEF11O60813 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAMEF11O60813 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRAMEF11O60813 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAMEF11O60813 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEF11O60813 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEF11O60813 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEF11O60813 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRAMEF11O60813 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRAMEF11O60813 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRAMEF11O60813 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRAMEF11O60813 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF11O60813 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF11O60813 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF11O60813 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRAMEF11O60813 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRAMEF11O60813 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PRAMEF11O60813 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRAMEF11O60813 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAMEF11O60813 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF11O60813 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF11O60813 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAMEF11O60813 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAMEF11O60813 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF11O60813 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF11O60813 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF11O60813 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF11O60813 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF11O60813 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF11O60813 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF11O60813 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF11O60813 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF11O60813 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF11O60813 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAMEF11O60813 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAMEF11O60813 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAMEF11O60813 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAMEF11O60813 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAMEF11O60813 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAMEF11O60813 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAMEF11O60813 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRAMEF11O60813 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRAMEF11O60813 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRAMEF11O60813 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRAMEF11O60813 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRAMEF11O60813 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRAMEF11O60813 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRAMEF11O60813 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRAMEF11O60813 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRAMEF11O60813 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRAMEF11O60813 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRAMEF11O60813 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRAMEF11O60813 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRAMEF11O60813 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRAMEF11O60813 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRAMEF11O60813 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRAMEF11O60813 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRAMEF11O60813 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRAMEF11O60813 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRAMEF11O60813 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PRAMEF11O60813 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PRAMEF11O60813 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRAMEF11O60813 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRAMEF11O60813 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRAMEF11O60813 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRAMEF11O60813 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRAMEF11O60813 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF11O60813 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF11O60813 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF11O60813 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF11O60813 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRAMEF11O60813 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRAMEF11O60813 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRAMEF11O60813 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.8 ms