Protein–RNA interactions for Protein: O60469

DSCAM, Down syndrome cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 2,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSCAMO60469 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSCAMO60469 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSCAMO60469 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSCAMO60469 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSCAMO60469 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSCAMO60469 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSCAMO60469 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSCAMO60469 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSCAMO60469 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSCAMO60469 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DSCAMO60469 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSCAMO60469 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSCAMO60469 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSCAMO60469 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSCAMO60469 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSCAMO60469 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSCAMO60469 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSCAMO60469 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSCAMO60469 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSCAMO60469 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSCAMO60469 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSCAMO60469 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSCAMO60469 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DSCAMO60469 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DSCAMO60469 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DSCAMO60469 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DSCAMO60469 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSCAMO60469 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSCAMO60469 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSCAMO60469 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSCAMO60469 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSCAMO60469 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSCAMO60469 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSCAMO60469 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSCAMO60469 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSCAMO60469 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSCAMO60469 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSCAMO60469 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSCAMO60469 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSCAMO60469 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSCAMO60469 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DSCAMO60469 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSCAMO60469 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSCAMO60469 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSCAMO60469 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DSCAMO60469 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSCAMO60469 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSCAMO60469 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSCAMO60469 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSCAMO60469 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSCAMO60469 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSCAMO60469 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSCAMO60469 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSCAMO60469 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSCAMO60469 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSCAMO60469 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSCAMO60469 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSCAMO60469 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSCAMO60469 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSCAMO60469 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSCAMO60469 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSCAMO60469 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSCAMO60469 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSCAMO60469 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
DSCAMO60469 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSCAMO60469 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSCAMO60469 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSCAMO60469 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSCAMO60469 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSCAMO60469 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSCAMO60469 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSCAMO60469 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSCAMO60469 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSCAMO60469 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSCAMO60469 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSCAMO60469 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSCAMO60469 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSCAMO60469 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSCAMO60469 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSCAMO60469 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSCAMO60469 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSCAMO60469 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSCAMO60469 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DSCAMO60469 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DSCAMO60469 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSCAMO60469 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSCAMO60469 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSCAMO60469 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSCAMO60469 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSCAMO60469 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSCAMO60469 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSCAMO60469 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSCAMO60469 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSCAMO60469 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DSCAMO60469 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSCAMO60469 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSCAMO60469 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSCAMO60469 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DSCAMO60469 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSCAMO60469 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms