Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCO2O43819 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCO2O43819 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCO2O43819 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCO2O43819 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCO2O43819 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCO2O43819 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCO2O43819 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCO2O43819 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCO2O43819 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCO2O43819 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SCO2O43819 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCO2O43819 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCO2O43819 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCO2O43819 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCO2O43819 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCO2O43819 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCO2O43819 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCO2O43819 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCO2O43819 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCO2O43819 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCO2O43819 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCO2O43819 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCO2O43819 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCO2O43819 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCO2O43819 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCO2O43819 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCO2O43819 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCO2O43819 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCO2O43819 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCO2O43819 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCO2O43819 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCO2O43819 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCO2O43819 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCO2O43819 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCO2O43819 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCO2O43819 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCO2O43819 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCO2O43819 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCO2O43819 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCO2O43819 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCO2O43819 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCO2O43819 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCO2O43819 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCO2O43819 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCO2O43819 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SCO2O43819 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCO2O43819 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCO2O43819 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCO2O43819 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCO2O43819 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCO2O43819 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SCO2O43819 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCO2O43819 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCO2O43819 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCO2O43819 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCO2O43819 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCO2O43819 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCO2O43819 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCO2O43819 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCO2O43819 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCO2O43819 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCO2O43819 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCO2O43819 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCO2O43819 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCO2O43819 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCO2O43819 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCO2O43819 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCO2O43819 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCO2O43819 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCO2O43819 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCO2O43819 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCO2O43819 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCO2O43819 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCO2O43819 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCO2O43819 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCO2O43819 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SCO2O43819 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCO2O43819 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCO2O43819 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCO2O43819 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCO2O43819 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCO2O43819 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCO2O43819 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCO2O43819 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCO2O43819 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCO2O43819 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCO2O43819 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCO2O43819 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCO2O43819 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCO2O43819 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCO2O43819 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCO2O43819 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCO2O43819 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCO2O43819 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCO2O43819 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCO2O43819 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCO2O43819 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCO2O43819 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCO2O43819 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms