Protein–RNA interactions for Protein: O43790

KRT86, Keratin, type II cuticular Hb6, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT86O43790 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT86O43790 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT86O43790 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT86O43790 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT86O43790 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT86O43790 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT86O43790 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT86O43790 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT86O43790 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT86O43790 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT86O43790 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT86O43790 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT86O43790 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
KRT86O43790 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT86O43790 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KRT86O43790 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT86O43790 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT86O43790 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT86O43790 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT86O43790 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT86O43790 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KRT86O43790 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KRT86O43790 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT86O43790 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT86O43790 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT86O43790 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT86O43790 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT86O43790 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT86O43790 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT86O43790 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT86O43790 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT86O43790 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT86O43790 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT86O43790 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT86O43790 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT86O43790 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KRT86O43790 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT86O43790 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT86O43790 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT86O43790 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT86O43790 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT86O43790 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT86O43790 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.83■■■□□ 2.2
KRT86O43790 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT86O43790 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT86O43790 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT86O43790 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT86O43790 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT86O43790 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT86O43790 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT86O43790 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT86O43790 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT86O43790 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT86O43790 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT86O43790 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT86O43790 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT86O43790 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT86O43790 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT86O43790 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT86O43790 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT86O43790 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT86O43790 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT86O43790 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT86O43790 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KRT86O43790 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KRT86O43790 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KRT86O43790 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT86O43790 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT86O43790 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT86O43790 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT86O43790 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT86O43790 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT86O43790 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT86O43790 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT86O43790 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT86O43790 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT86O43790 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT86O43790 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT86O43790 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT86O43790 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT86O43790 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT86O43790 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT86O43790 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT86O43790 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT86O43790 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT86O43790 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT86O43790 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT86O43790 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT86O43790 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT86O43790 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT86O43790 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT86O43790 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT86O43790 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT86O43790 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT86O43790 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT86O43790 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
KRT86O43790 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT86O43790 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT86O43790 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT86O43790 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms