Protein–RNA interactions for Protein: O43747

AP1G1, AP-1 complex subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1G1O43747 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AP1G1O43747 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AP1G1O43747 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AP1G1O43747 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AP1G1O43747 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AP1G1O43747 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AP1G1O43747 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AP1G1O43747 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AP1G1O43747 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AP1G1O43747 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
AP1G1O43747 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
AP1G1O43747 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AP1G1O43747 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
AP1G1O43747 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AP1G1O43747 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
AP1G1O43747 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AP1G1O43747 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AP1G1O43747 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AP1G1O43747 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AP1G1O43747 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AP1G1O43747 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AP1G1O43747 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
AP1G1O43747 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AP1G1O43747 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AP1G1O43747 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AP1G1O43747 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
AP1G1O43747 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AP1G1O43747 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AP1G1O43747 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
AP1G1O43747 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AP1G1O43747 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
AP1G1O43747 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AP1G1O43747 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AP1G1O43747 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AP1G1O43747 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AP1G1O43747 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AP1G1O43747 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AP1G1O43747 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
AP1G1O43747 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
AP1G1O43747 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AP1G1O43747 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AP1G1O43747 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AP1G1O43747 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AP1G1O43747 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AP1G1O43747 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AP1G1O43747 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AP1G1O43747 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AP1G1O43747 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
AP1G1O43747 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AP1G1O43747 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AP1G1O43747 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
AP1G1O43747 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AP1G1O43747 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AP1G1O43747 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AP1G1O43747 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AP1G1O43747 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AP1G1O43747 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
AP1G1O43747 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AP1G1O43747 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AP1G1O43747 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AP1G1O43747 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AP1G1O43747 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AP1G1O43747 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AP1G1O43747 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AP1G1O43747 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AP1G1O43747 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AP1G1O43747 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
AP1G1O43747 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
AP1G1O43747 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AP1G1O43747 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AP1G1O43747 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AP1G1O43747 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AP1G1O43747 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AP1G1O43747 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AP1G1O43747 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AP1G1O43747 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AP1G1O43747 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AP1G1O43747 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AP1G1O43747 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AP1G1O43747 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AP1G1O43747 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AP1G1O43747 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AP1G1O43747 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AP1G1O43747 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
AP1G1O43747 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AP1G1O43747 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
AP1G1O43747 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AP1G1O43747 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AP1G1O43747 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AP1G1O43747 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AP1G1O43747 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AP1G1O43747 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AP1G1O43747 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AP1G1O43747 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AP1G1O43747 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AP1G1O43747 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AP1G1O43747 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
AP1G1O43747 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
AP1G1O43747 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AP1G1O43747 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms