Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITM2AO43736 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITM2AO43736 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITM2AO43736 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITM2AO43736 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITM2AO43736 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITM2AO43736 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ITM2AO43736 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITM2AO43736 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITM2AO43736 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITM2AO43736 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITM2AO43736 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITM2AO43736 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITM2AO43736 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITM2AO43736 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITM2AO43736 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITM2AO43736 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITM2AO43736 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITM2AO43736 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITM2AO43736 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITM2AO43736 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITM2AO43736 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITM2AO43736 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITM2AO43736 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITM2AO43736 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITM2AO43736 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITM2AO43736 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITM2AO43736 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITM2AO43736 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITM2AO43736 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITM2AO43736 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITM2AO43736 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITM2AO43736 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITM2AO43736 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITM2AO43736 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITM2AO43736 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITM2AO43736 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITM2AO43736 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITM2AO43736 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITM2AO43736 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITM2AO43736 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITM2AO43736 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITM2AO43736 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITM2AO43736 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITM2AO43736 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITM2AO43736 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITM2AO43736 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITM2AO43736 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ITM2AO43736 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITM2AO43736 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITM2AO43736 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITM2AO43736 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITM2AO43736 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITM2AO43736 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ITM2AO43736 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITM2AO43736 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITM2AO43736 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ITM2AO43736 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITM2AO43736 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITM2AO43736 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITM2AO43736 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITM2AO43736 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ITM2AO43736 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITM2AO43736 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITM2AO43736 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITM2AO43736 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITM2AO43736 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITM2AO43736 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITM2AO43736 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITM2AO43736 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITM2AO43736 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITM2AO43736 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITM2AO43736 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITM2AO43736 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITM2AO43736 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ITM2AO43736 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITM2AO43736 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITM2AO43736 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITM2AO43736 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITM2AO43736 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITM2AO43736 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITM2AO43736 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITM2AO43736 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITM2AO43736 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITM2AO43736 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITM2AO43736 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITM2AO43736 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITM2AO43736 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITM2AO43736 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITM2AO43736 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITM2AO43736 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITM2AO43736 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITM2AO43736 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITM2AO43736 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITM2AO43736 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITM2AO43736 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITM2AO43736 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITM2AO43736 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITM2AO43736 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITM2AO43736 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms