Protein–RNA interactions for Protein: O15118

NPC1, Niemann-Pick C1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1O15118 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPC1O15118 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPC1O15118 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPC1O15118 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPC1O15118 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPC1O15118 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPC1O15118 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPC1O15118 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPC1O15118 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPC1O15118 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPC1O15118 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPC1O15118 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPC1O15118 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NPC1O15118 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPC1O15118 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPC1O15118 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPC1O15118 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPC1O15118 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPC1O15118 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPC1O15118 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPC1O15118 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPC1O15118 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPC1O15118 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NPC1O15118 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPC1O15118 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NPC1O15118 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPC1O15118 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NPC1O15118 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NPC1O15118 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NPC1O15118 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NPC1O15118 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NPC1O15118 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NPC1O15118 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NPC1O15118 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NPC1O15118 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NPC1O15118 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NPC1O15118 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NPC1O15118 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NPC1O15118 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPC1O15118 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPC1O15118 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPC1O15118 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPC1O15118 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NPC1O15118 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPC1O15118 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPC1O15118 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPC1O15118 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPC1O15118 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPC1O15118 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPC1O15118 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPC1O15118 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPC1O15118 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPC1O15118 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPC1O15118 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPC1O15118 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPC1O15118 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPC1O15118 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPC1O15118 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPC1O15118 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPC1O15118 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPC1O15118 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPC1O15118 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPC1O15118 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPC1O15118 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPC1O15118 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPC1O15118 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPC1O15118 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPC1O15118 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NPC1O15118 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPC1O15118 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPC1O15118 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPC1O15118 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPC1O15118 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPC1O15118 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPC1O15118 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPC1O15118 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPC1O15118 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NPC1O15118 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NPC1O15118 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NPC1O15118 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NPC1O15118 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPC1O15118 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPC1O15118 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPC1O15118 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPC1O15118 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NPC1O15118 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NPC1O15118 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPC1O15118 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPC1O15118 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NPC1O15118 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NPC1O15118 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPC1O15118 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPC1O15118 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPC1O15118 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPC1O15118 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPC1O15118 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPC1O15118 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPC1O15118 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPC1O15118 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPC1O15118 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms