Protein–RNA interactions for Protein: O14966

RAB29, Ras-related protein Rab-7L1, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB29O14966 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB29O14966 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB29O14966 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB29O14966 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB29O14966 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB29O14966 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB29O14966 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB29O14966 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB29O14966 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB29O14966 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB29O14966 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB29O14966 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB29O14966 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB29O14966 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB29O14966 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB29O14966 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB29O14966 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB29O14966 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB29O14966 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB29O14966 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB29O14966 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB29O14966 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB29O14966 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB29O14966 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB29O14966 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB29O14966 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB29O14966 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB29O14966 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB29O14966 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB29O14966 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB29O14966 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB29O14966 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB29O14966 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB29O14966 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB29O14966 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB29O14966 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB29O14966 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB29O14966 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB29O14966 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB29O14966 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB29O14966 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB29O14966 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB29O14966 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB29O14966 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB29O14966 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB29O14966 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB29O14966 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB29O14966 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB29O14966 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB29O14966 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB29O14966 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB29O14966 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB29O14966 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB29O14966 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB29O14966 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB29O14966 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB29O14966 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB29O14966 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB29O14966 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB29O14966 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB29O14966 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB29O14966 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB29O14966 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB29O14966 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB29O14966 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB29O14966 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB29O14966 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB29O14966 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB29O14966 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB29O14966 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB29O14966 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB29O14966 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB29O14966 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB29O14966 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB29O14966 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB29O14966 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB29O14966 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB29O14966 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB29O14966 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB29O14966 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB29O14966 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB29O14966 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB29O14966 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB29O14966 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB29O14966 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB29O14966 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB29O14966 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB29O14966 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB29O14966 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB29O14966 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB29O14966 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB29O14966 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB29O14966 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB29O14966 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB29O14966 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB29O14966 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB29O14966 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB29O14966 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB29O14966 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB29O14966 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms