Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
O00370 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
O00370 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
O00370 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
O00370 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
O00370 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
O00370 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
O00370 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
O00370 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
O00370 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
O00370 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
O00370 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
O00370 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
O00370 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
O00370 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
O00370 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
O00370 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
O00370 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
O00370 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
O00370 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
O00370 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
O00370 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
O00370 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
O00370 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
O00370 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
O00370 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
O00370 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
O00370 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
O00370 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
O00370 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
O00370 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
O00370 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
O00370 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
O00370 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
O00370 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
O00370 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
O00370 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
O00370 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
O00370 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
O00370 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
O00370 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
O00370 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
O00370 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
O00370 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
O00370 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
O00370 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
O00370 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
O00370 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
O00370 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
O00370 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
O00370 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
O00370 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
O00370 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
O00370 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
O00370 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
O00370 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
O00370 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
O00370 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
O00370 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
O00370 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
O00370 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
O00370 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
O00370 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
O00370 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
O00370 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
O00370 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
O00370 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
O00370 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
O00370 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
O00370 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
O00370 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
O00370 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
O00370 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
O00370 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
O00370 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
O00370 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
O00370 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
O00370 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
O00370 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
O00370 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
O00370 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
O00370 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
O00370 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
O00370 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
O00370 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
O00370 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
O00370 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
O00370 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
O00370 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
O00370 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
O00370 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
O00370 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
O00370 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
O00370 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
O00370 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
O00370 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
O00370 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
O00370 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
O00370 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
O00370 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms