Protein–RNA interactions for Protein: O00142

TK2, Thymidine kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK2O00142 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TK2O00142 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TK2O00142 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TK2O00142 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TK2O00142 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TK2O00142 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TK2O00142 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TK2O00142 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TK2O00142 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TK2O00142 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TK2O00142 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TK2O00142 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TK2O00142 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TK2O00142 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TK2O00142 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TK2O00142 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TK2O00142 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TK2O00142 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TK2O00142 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TK2O00142 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TK2O00142 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TK2O00142 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TK2O00142 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TK2O00142 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TK2O00142 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TK2O00142 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TK2O00142 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TK2O00142 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TK2O00142 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TK2O00142 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TK2O00142 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TK2O00142 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TK2O00142 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TK2O00142 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TK2O00142 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TK2O00142 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TK2O00142 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TK2O00142 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TK2O00142 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TK2O00142 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TK2O00142 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TK2O00142 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TK2O00142 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TK2O00142 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TK2O00142 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TK2O00142 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TK2O00142 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TK2O00142 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TK2O00142 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TK2O00142 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TK2O00142 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TK2O00142 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TK2O00142 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TK2O00142 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TK2O00142 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TK2O00142 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TK2O00142 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TK2O00142 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TK2O00142 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TK2O00142 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TK2O00142 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TK2O00142 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TK2O00142 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TK2O00142 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TK2O00142 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TK2O00142 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TK2O00142 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TK2O00142 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TK2O00142 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TK2O00142 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TK2O00142 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TK2O00142 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TK2O00142 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TK2O00142 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TK2O00142 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TK2O00142 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TK2O00142 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TK2O00142 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TK2O00142 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TK2O00142 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TK2O00142 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TK2O00142 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TK2O00142 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TK2O00142 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TK2O00142 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TK2O00142 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TK2O00142 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TK2O00142 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TK2O00142 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TK2O00142 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TK2O00142 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TK2O00142 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TK2O00142 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TK2O00142 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TK2O00142 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TK2O00142 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TK2O00142 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TK2O00142 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TK2O00142 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TK2O00142 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms