Protein–RNA interactions for Protein: H3BML4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BML4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3BML4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BML4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BML4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BML4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BML4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
H3BML4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
H3BML4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BML4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BML4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BML4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H3BML4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BML4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BML4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BML4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BML4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H3BML4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
H3BML4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H3BML4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BML4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BML4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H3BML4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
H3BML4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
H3BML4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H3BML4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H3BML4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BML4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BML4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BML4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BML4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BML4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BML4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BML4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BML4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BML4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BML4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BML4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BML4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BML4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BML4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BML4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BML4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BML4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BML4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BML4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
H3BML4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BML4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BML4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BML4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BML4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BML4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BML4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BML4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
H3BML4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H3BML4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H3BML4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BML4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BML4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BML4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BML4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BML4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BML4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BML4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BML4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BML4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BML4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BML4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BML4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
H3BML4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BML4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BML4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
H3BML4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BML4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BML4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BML4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BML4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BML4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BML4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BML4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BML4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BML4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BML4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BML4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BML4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BML4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BML4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BML4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BML4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BML4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BML4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BML4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BML4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BML4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BML4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BML4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BML4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BML4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BML4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BML4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BML4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms