Protein–RNA interactions for Protein: H0YC42

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H0YC42 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H0YC42 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H0YC42 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H0YC42 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
H0YC42 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
H0YC42 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
H0YC42 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
H0YC42 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
H0YC42 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H0YC42 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H0YC42 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H0YC42 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H0YC42 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
H0YC42 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H0YC42 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H0YC42 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H0YC42 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H0YC42 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H0YC42 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H0YC42 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
H0YC42 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
H0YC42 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
H0YC42 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H0YC42 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H0YC42 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H0YC42 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H0YC42 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
H0YC42 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
H0YC42 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H0YC42 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
H0YC42 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H0YC42 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
H0YC42 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H0YC42 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H0YC42 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H0YC42 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H0YC42 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H0YC42 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H0YC42 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
H0YC42 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H0YC42 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H0YC42 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H0YC42 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H0YC42 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H0YC42 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H0YC42 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H0YC42 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H0YC42 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H0YC42 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H0YC42 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H0YC42 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H0YC42 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H0YC42 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H0YC42 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H0YC42 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H0YC42 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H0YC42 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
H0YC42 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H0YC42 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H0YC42 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H0YC42 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
H0YC42 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H0YC42 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H0YC42 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H0YC42 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H0YC42 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H0YC42 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H0YC42 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H0YC42 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H0YC42 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H0YC42 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H0YC42 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H0YC42 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H0YC42 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
H0YC42 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H0YC42 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H0YC42 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H0YC42 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H0YC42 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H0YC42 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H0YC42 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H0YC42 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H0YC42 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H0YC42 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H0YC42 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H0YC42 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H0YC42 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H0YC42 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H0YC42 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H0YC42 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H0YC42 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H0YC42 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H0YC42 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H0YC42 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H0YC42 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H0YC42 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H0YC42 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H0YC42 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H0YC42 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H0YC42 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms