Protein–RNA interactions for Protein: G3V0Z9

LYNX1, HCG2043033, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1G3V0Z9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LYNX1G3V0Z9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LYNX1G3V0Z9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYNX1G3V0Z9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LYNX1G3V0Z9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LYNX1G3V0Z9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LYNX1G3V0Z9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYNX1G3V0Z9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYNX1G3V0Z9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LYNX1G3V0Z9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LYNX1G3V0Z9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYNX1G3V0Z9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYNX1G3V0Z9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LYNX1G3V0Z9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYNX1G3V0Z9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LYNX1G3V0Z9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYNX1G3V0Z9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYNX1G3V0Z9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYNX1G3V0Z9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYNX1G3V0Z9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYNX1G3V0Z9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYNX1G3V0Z9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYNX1G3V0Z9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYNX1G3V0Z9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYNX1G3V0Z9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LYNX1G3V0Z9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LYNX1G3V0Z9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYNX1G3V0Z9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYNX1G3V0Z9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYNX1G3V0Z9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYNX1G3V0Z9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYNX1G3V0Z9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYNX1G3V0Z9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LYNX1G3V0Z9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYNX1G3V0Z9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYNX1G3V0Z9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYNX1G3V0Z9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LYNX1G3V0Z9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYNX1G3V0Z9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYNX1G3V0Z9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYNX1G3V0Z9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYNX1G3V0Z9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYNX1G3V0Z9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYNX1G3V0Z9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYNX1G3V0Z9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYNX1G3V0Z9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYNX1G3V0Z9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYNX1G3V0Z9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYNX1G3V0Z9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYNX1G3V0Z9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYNX1G3V0Z9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYNX1G3V0Z9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYNX1G3V0Z9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYNX1G3V0Z9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LYNX1G3V0Z9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYNX1G3V0Z9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYNX1G3V0Z9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYNX1G3V0Z9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYNX1G3V0Z9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYNX1G3V0Z9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYNX1G3V0Z9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LYNX1G3V0Z9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYNX1G3V0Z9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYNX1G3V0Z9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYNX1G3V0Z9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYNX1G3V0Z9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYNX1G3V0Z9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYNX1G3V0Z9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYNX1G3V0Z9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYNX1G3V0Z9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYNX1G3V0Z9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYNX1G3V0Z9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYNX1G3V0Z9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYNX1G3V0Z9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYNX1G3V0Z9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYNX1G3V0Z9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYNX1G3V0Z9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYNX1G3V0Z9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYNX1G3V0Z9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYNX1G3V0Z9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYNX1G3V0Z9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYNX1G3V0Z9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYNX1G3V0Z9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYNX1G3V0Z9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYNX1G3V0Z9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYNX1G3V0Z9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYNX1G3V0Z9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LYNX1G3V0Z9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYNX1G3V0Z9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYNX1G3V0Z9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYNX1G3V0Z9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYNX1G3V0Z9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYNX1G3V0Z9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYNX1G3V0Z9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYNX1G3V0Z9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYNX1G3V0Z9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYNX1G3V0Z9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYNX1G3V0Z9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYNX1G3V0Z9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYNX1G3V0Z9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms