Protein–RNA interactions for Protein: E9PRG8

C11orf98, Uncharacterized protein C11orf98, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf98E9PRG8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C11orf98E9PRG8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C11orf98E9PRG8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C11orf98E9PRG8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C11orf98E9PRG8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C11orf98E9PRG8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C11orf98E9PRG8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C11orf98E9PRG8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C11orf98E9PRG8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf98E9PRG8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf98E9PRG8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C11orf98E9PRG8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C11orf98E9PRG8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C11orf98E9PRG8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C11orf98E9PRG8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C11orf98E9PRG8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C11orf98E9PRG8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C11orf98E9PRG8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C11orf98E9PRG8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C11orf98E9PRG8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C11orf98E9PRG8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C11orf98E9PRG8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C11orf98E9PRG8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C11orf98E9PRG8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C11orf98E9PRG8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C11orf98E9PRG8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C11orf98E9PRG8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C11orf98E9PRG8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C11orf98E9PRG8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C11orf98E9PRG8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C11orf98E9PRG8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
C11orf98E9PRG8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C11orf98E9PRG8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C11orf98E9PRG8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C11orf98E9PRG8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C11orf98E9PRG8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C11orf98E9PRG8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C11orf98E9PRG8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C11orf98E9PRG8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C11orf98E9PRG8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C11orf98E9PRG8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C11orf98E9PRG8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C11orf98E9PRG8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C11orf98E9PRG8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C11orf98E9PRG8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C11orf98E9PRG8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C11orf98E9PRG8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C11orf98E9PRG8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C11orf98E9PRG8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C11orf98E9PRG8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C11orf98E9PRG8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C11orf98E9PRG8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C11orf98E9PRG8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C11orf98E9PRG8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
C11orf98E9PRG8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C11orf98E9PRG8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C11orf98E9PRG8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C11orf98E9PRG8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
C11orf98E9PRG8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C11orf98E9PRG8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C11orf98E9PRG8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C11orf98E9PRG8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C11orf98E9PRG8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C11orf98E9PRG8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C11orf98E9PRG8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C11orf98E9PRG8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C11orf98E9PRG8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C11orf98E9PRG8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C11orf98E9PRG8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C11orf98E9PRG8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C11orf98E9PRG8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C11orf98E9PRG8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C11orf98E9PRG8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C11orf98E9PRG8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C11orf98E9PRG8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C11orf98E9PRG8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C11orf98E9PRG8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C11orf98E9PRG8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C11orf98E9PRG8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C11orf98E9PRG8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C11orf98E9PRG8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C11orf98E9PRG8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C11orf98E9PRG8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C11orf98E9PRG8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C11orf98E9PRG8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C11orf98E9PRG8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C11orf98E9PRG8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C11orf98E9PRG8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C11orf98E9PRG8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C11orf98E9PRG8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C11orf98E9PRG8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C11orf98E9PRG8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C11orf98E9PRG8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C11orf98E9PRG8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C11orf98E9PRG8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C11orf98E9PRG8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C11orf98E9PRG8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C11orf98E9PRG8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C11orf98E9PRG8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C11orf98E9PRG8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms