Protein–RNA interactions for Protein: A8MXK1

VSTM5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM5A8MXK1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSTM5A8MXK1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSTM5A8MXK1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSTM5A8MXK1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VSTM5A8MXK1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VSTM5A8MXK1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VSTM5A8MXK1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VSTM5A8MXK1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VSTM5A8MXK1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VSTM5A8MXK1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSTM5A8MXK1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VSTM5A8MXK1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VSTM5A8MXK1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VSTM5A8MXK1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VSTM5A8MXK1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VSTM5A8MXK1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VSTM5A8MXK1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSTM5A8MXK1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSTM5A8MXK1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSTM5A8MXK1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSTM5A8MXK1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSTM5A8MXK1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSTM5A8MXK1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSTM5A8MXK1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSTM5A8MXK1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSTM5A8MXK1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSTM5A8MXK1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSTM5A8MXK1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VSTM5A8MXK1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSTM5A8MXK1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM5A8MXK1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM5A8MXK1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM5A8MXK1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM5A8MXK1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VSTM5A8MXK1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSTM5A8MXK1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSTM5A8MXK1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSTM5A8MXK1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSTM5A8MXK1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSTM5A8MXK1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSTM5A8MXK1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSTM5A8MXK1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSTM5A8MXK1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSTM5A8MXK1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSTM5A8MXK1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSTM5A8MXK1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSTM5A8MXK1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSTM5A8MXK1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSTM5A8MXK1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSTM5A8MXK1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VSTM5A8MXK1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VSTM5A8MXK1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VSTM5A8MXK1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VSTM5A8MXK1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VSTM5A8MXK1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VSTM5A8MXK1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VSTM5A8MXK1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSTM5A8MXK1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VSTM5A8MXK1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VSTM5A8MXK1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VSTM5A8MXK1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VSTM5A8MXK1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VSTM5A8MXK1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VSTM5A8MXK1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSTM5A8MXK1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSTM5A8MXK1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSTM5A8MXK1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSTM5A8MXK1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VSTM5A8MXK1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VSTM5A8MXK1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VSTM5A8MXK1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VSTM5A8MXK1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VSTM5A8MXK1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSTM5A8MXK1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSTM5A8MXK1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VSTM5A8MXK1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSTM5A8MXK1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSTM5A8MXK1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSTM5A8MXK1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSTM5A8MXK1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VSTM5A8MXK1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VSTM5A8MXK1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VSTM5A8MXK1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VSTM5A8MXK1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VSTM5A8MXK1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSTM5A8MXK1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSTM5A8MXK1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VSTM5A8MXK1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VSTM5A8MXK1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VSTM5A8MXK1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM5A8MXK1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM5A8MXK1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSTM5A8MXK1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSTM5A8MXK1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSTM5A8MXK1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSTM5A8MXK1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSTM5A8MXK1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSTM5A8MXK1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSTM5A8MXK1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSTM5A8MXK1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms