Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF839A8K0R7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF839A8K0R7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF839A8K0R7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF839A8K0R7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF839A8K0R7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF839A8K0R7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF839A8K0R7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF839A8K0R7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF839A8K0R7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF839A8K0R7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF839A8K0R7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF839A8K0R7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF839A8K0R7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF839A8K0R7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF839A8K0R7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF839A8K0R7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF839A8K0R7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF839A8K0R7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF839A8K0R7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF839A8K0R7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF839A8K0R7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF839A8K0R7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF839A8K0R7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF839A8K0R7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF839A8K0R7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF839A8K0R7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF839A8K0R7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF839A8K0R7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF839A8K0R7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZNF839A8K0R7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF839A8K0R7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF839A8K0R7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF839A8K0R7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF839A8K0R7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF839A8K0R7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF839A8K0R7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF839A8K0R7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF839A8K0R7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF839A8K0R7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF839A8K0R7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF839A8K0R7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF839A8K0R7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF839A8K0R7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF839A8K0R7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF839A8K0R7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF839A8K0R7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF839A8K0R7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF839A8K0R7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF839A8K0R7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF839A8K0R7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF839A8K0R7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF839A8K0R7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF839A8K0R7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF839A8K0R7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF839A8K0R7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF839A8K0R7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF839A8K0R7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF839A8K0R7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF839A8K0R7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF839A8K0R7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF839A8K0R7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF839A8K0R7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF839A8K0R7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF839A8K0R7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF839A8K0R7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF839A8K0R7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF839A8K0R7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF839A8K0R7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF839A8K0R7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF839A8K0R7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF839A8K0R7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF839A8K0R7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF839A8K0R7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF839A8K0R7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF839A8K0R7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF839A8K0R7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF839A8K0R7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF839A8K0R7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF839A8K0R7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF839A8K0R7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF839A8K0R7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF839A8K0R7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF839A8K0R7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF839A8K0R7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF839A8K0R7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF839A8K0R7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF839A8K0R7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF839A8K0R7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF839A8K0R7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF839A8K0R7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF839A8K0R7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF839A8K0R7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF839A8K0R7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF839A8K0R7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF839A8K0R7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF839A8K0R7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF839A8K0R7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF839A8K0R7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF839A8K0R7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms