Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEMP2A6NFY4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEMP2A6NFY4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NEMP2A6NFY4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEMP2A6NFY4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEMP2A6NFY4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEMP2A6NFY4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NEMP2A6NFY4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEMP2A6NFY4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEMP2A6NFY4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEMP2A6NFY4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEMP2A6NFY4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEMP2A6NFY4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEMP2A6NFY4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEMP2A6NFY4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEMP2A6NFY4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEMP2A6NFY4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEMP2A6NFY4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEMP2A6NFY4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEMP2A6NFY4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEMP2A6NFY4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEMP2A6NFY4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEMP2A6NFY4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NEMP2A6NFY4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEMP2A6NFY4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEMP2A6NFY4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEMP2A6NFY4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEMP2A6NFY4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEMP2A6NFY4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEMP2A6NFY4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEMP2A6NFY4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEMP2A6NFY4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEMP2A6NFY4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEMP2A6NFY4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEMP2A6NFY4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEMP2A6NFY4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEMP2A6NFY4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEMP2A6NFY4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEMP2A6NFY4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEMP2A6NFY4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NEMP2A6NFY4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NEMP2A6NFY4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEMP2A6NFY4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEMP2A6NFY4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEMP2A6NFY4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEMP2A6NFY4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NEMP2A6NFY4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEMP2A6NFY4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEMP2A6NFY4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEMP2A6NFY4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEMP2A6NFY4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEMP2A6NFY4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEMP2A6NFY4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEMP2A6NFY4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEMP2A6NFY4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEMP2A6NFY4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEMP2A6NFY4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEMP2A6NFY4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEMP2A6NFY4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEMP2A6NFY4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEMP2A6NFY4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEMP2A6NFY4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEMP2A6NFY4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEMP2A6NFY4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEMP2A6NFY4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NEMP2A6NFY4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEMP2A6NFY4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEMP2A6NFY4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEMP2A6NFY4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEMP2A6NFY4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEMP2A6NFY4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEMP2A6NFY4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEMP2A6NFY4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEMP2A6NFY4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEMP2A6NFY4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEMP2A6NFY4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEMP2A6NFY4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEMP2A6NFY4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NEMP2A6NFY4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NEMP2A6NFY4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NEMP2A6NFY4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEMP2A6NFY4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEMP2A6NFY4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEMP2A6NFY4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEMP2A6NFY4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEMP2A6NFY4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEMP2A6NFY4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEMP2A6NFY4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEMP2A6NFY4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEMP2A6NFY4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEMP2A6NFY4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEMP2A6NFY4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NEMP2A6NFY4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEMP2A6NFY4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEMP2A6NFY4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEMP2A6NFY4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEMP2A6NFY4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEMP2A6NFY4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEMP2A6NFY4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NEMP2A6NFY4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms