Protein–RNA interactions for Protein: A6NDY0

PABPN1L, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPN1LA6NDY0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PABPN1LA6NDY0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PABPN1LA6NDY0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PABPN1LA6NDY0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PABPN1LA6NDY0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PABPN1LA6NDY0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PABPN1LA6NDY0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PABPN1LA6NDY0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PABPN1LA6NDY0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PABPN1LA6NDY0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PABPN1LA6NDY0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PABPN1LA6NDY0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PABPN1LA6NDY0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PABPN1LA6NDY0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PABPN1LA6NDY0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PABPN1LA6NDY0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PABPN1LA6NDY0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PABPN1LA6NDY0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PABPN1LA6NDY0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PABPN1LA6NDY0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PABPN1LA6NDY0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PABPN1LA6NDY0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PABPN1LA6NDY0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PABPN1LA6NDY0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PABPN1LA6NDY0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PABPN1LA6NDY0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PABPN1LA6NDY0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PABPN1LA6NDY0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PABPN1LA6NDY0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PABPN1LA6NDY0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PABPN1LA6NDY0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PABPN1LA6NDY0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PABPN1LA6NDY0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PABPN1LA6NDY0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PABPN1LA6NDY0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PABPN1LA6NDY0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PABPN1LA6NDY0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PABPN1LA6NDY0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PABPN1LA6NDY0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PABPN1LA6NDY0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PABPN1LA6NDY0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PABPN1LA6NDY0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PABPN1LA6NDY0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PABPN1LA6NDY0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PABPN1LA6NDY0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PABPN1LA6NDY0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PABPN1LA6NDY0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PABPN1LA6NDY0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PABPN1LA6NDY0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PABPN1LA6NDY0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PABPN1LA6NDY0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PABPN1LA6NDY0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PABPN1LA6NDY0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PABPN1LA6NDY0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PABPN1LA6NDY0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PABPN1LA6NDY0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PABPN1LA6NDY0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PABPN1LA6NDY0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PABPN1LA6NDY0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PABPN1LA6NDY0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PABPN1LA6NDY0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PABPN1LA6NDY0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PABPN1LA6NDY0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PABPN1LA6NDY0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PABPN1LA6NDY0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PABPN1LA6NDY0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PABPN1LA6NDY0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PABPN1LA6NDY0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PABPN1LA6NDY0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PABPN1LA6NDY0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PABPN1LA6NDY0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PABPN1LA6NDY0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PABPN1LA6NDY0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PABPN1LA6NDY0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PABPN1LA6NDY0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PABPN1LA6NDY0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PABPN1LA6NDY0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PABPN1LA6NDY0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PABPN1LA6NDY0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PABPN1LA6NDY0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PABPN1LA6NDY0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PABPN1LA6NDY0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PABPN1LA6NDY0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PABPN1LA6NDY0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PABPN1LA6NDY0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PABPN1LA6NDY0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PABPN1LA6NDY0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PABPN1LA6NDY0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PABPN1LA6NDY0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PABPN1LA6NDY0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PABPN1LA6NDY0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PABPN1LA6NDY0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PABPN1LA6NDY0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PABPN1LA6NDY0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PABPN1LA6NDY0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PABPN1LA6NDY0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PABPN1LA6NDY0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PABPN1LA6NDY0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PABPN1LA6NDY0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PABPN1LA6NDY0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms