Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GOLGA6CA6NDK9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GOLGA6CA6NDK9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GOLGA6CA6NDK9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GOLGA6CA6NDK9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
GOLGA6CA6NDK9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GOLGA6CA6NDK9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GOLGA6CA6NDK9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA6CA6NDK9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA6CA6NDK9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLGA6CA6NDK9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA6CA6NDK9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA6CA6NDK9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA6CA6NDK9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA6CA6NDK9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA6CA6NDK9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA6CA6NDK9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA6CA6NDK9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA6CA6NDK9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GOLGA6CA6NDK9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA6CA6NDK9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA6CA6NDK9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GOLGA6CA6NDK9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GOLGA6CA6NDK9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA6CA6NDK9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GOLGA6CA6NDK9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOLGA6CA6NDK9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOLGA6CA6NDK9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOLGA6CA6NDK9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GOLGA6CA6NDK9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA6CA6NDK9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA6CA6NDK9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA6CA6NDK9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA6CA6NDK9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA6CA6NDK9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA6CA6NDK9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA6CA6NDK9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA6CA6NDK9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA6CA6NDK9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA6CA6NDK9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA6CA6NDK9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA6CA6NDK9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GOLGA6CA6NDK9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GOLGA6CA6NDK9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA6CA6NDK9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA6CA6NDK9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA6CA6NDK9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA6CA6NDK9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA6CA6NDK9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA6CA6NDK9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA6CA6NDK9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA6CA6NDK9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA6CA6NDK9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA6CA6NDK9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOLGA6CA6NDK9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GOLGA6CA6NDK9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GOLGA6CA6NDK9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA6CA6NDK9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA6CA6NDK9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA6CA6NDK9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA6CA6NDK9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA6CA6NDK9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA6CA6NDK9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA6CA6NDK9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA6CA6NDK9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA6CA6NDK9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA6CA6NDK9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA6CA6NDK9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA6CA6NDK9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA6CA6NDK9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA6CA6NDK9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA6CA6NDK9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA6CA6NDK9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA6CA6NDK9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA6CA6NDK9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA6CA6NDK9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA6CA6NDK9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA6CA6NDK9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GOLGA6CA6NDK9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GOLGA6CA6NDK9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA6CA6NDK9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA6CA6NDK9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA6CA6NDK9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA6CA6NDK9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA6CA6NDK9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA6CA6NDK9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA6CA6NDK9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA6CA6NDK9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA6CA6NDK9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA6CA6NDK9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA6CA6NDK9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA6CA6NDK9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA6CA6NDK9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA6CA6NDK9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLGA6CA6NDK9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GOLGA6CA6NDK9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GOLGA6CA6NDK9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLGA6CA6NDK9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLGA6CA6NDK9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GOLGA6CA6NDK9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms