Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VWA8A3KMH1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
VWA8A3KMH1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VWA8A3KMH1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VWA8A3KMH1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VWA8A3KMH1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VWA8A3KMH1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VWA8A3KMH1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VWA8A3KMH1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VWA8A3KMH1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VWA8A3KMH1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VWA8A3KMH1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VWA8A3KMH1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
VWA8A3KMH1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VWA8A3KMH1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VWA8A3KMH1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VWA8A3KMH1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VWA8A3KMH1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VWA8A3KMH1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VWA8A3KMH1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VWA8A3KMH1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VWA8A3KMH1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VWA8A3KMH1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VWA8A3KMH1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
VWA8A3KMH1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
VWA8A3KMH1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
VWA8A3KMH1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VWA8A3KMH1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VWA8A3KMH1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VWA8A3KMH1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VWA8A3KMH1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VWA8A3KMH1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VWA8A3KMH1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VWA8A3KMH1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VWA8A3KMH1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VWA8A3KMH1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VWA8A3KMH1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
VWA8A3KMH1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
VWA8A3KMH1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
VWA8A3KMH1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VWA8A3KMH1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VWA8A3KMH1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VWA8A3KMH1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VWA8A3KMH1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VWA8A3KMH1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VWA8A3KMH1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VWA8A3KMH1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VWA8A3KMH1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
VWA8A3KMH1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
VWA8A3KMH1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
VWA8A3KMH1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VWA8A3KMH1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VWA8A3KMH1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VWA8A3KMH1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VWA8A3KMH1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VWA8A3KMH1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VWA8A3KMH1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VWA8A3KMH1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VWA8A3KMH1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VWA8A3KMH1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VWA8A3KMH1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VWA8A3KMH1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VWA8A3KMH1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VWA8A3KMH1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VWA8A3KMH1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VWA8A3KMH1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VWA8A3KMH1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
VWA8A3KMH1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VWA8A3KMH1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VWA8A3KMH1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VWA8A3KMH1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VWA8A3KMH1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VWA8A3KMH1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VWA8A3KMH1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
VWA8A3KMH1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VWA8A3KMH1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VWA8A3KMH1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VWA8A3KMH1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
VWA8A3KMH1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VWA8A3KMH1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VWA8A3KMH1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VWA8A3KMH1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VWA8A3KMH1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VWA8A3KMH1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VWA8A3KMH1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VWA8A3KMH1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
VWA8A3KMH1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VWA8A3KMH1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
VWA8A3KMH1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VWA8A3KMH1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
VWA8A3KMH1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
VWA8A3KMH1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
VWA8A3KMH1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
VWA8A3KMH1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
VWA8A3KMH1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VWA8A3KMH1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VWA8A3KMH1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VWA8A3KMH1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VWA8A3KMH1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VWA8A3KMH1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms