Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM89A2RUT3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM89A2RUT3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM89A2RUT3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM89A2RUT3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM89A2RUT3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM89A2RUT3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM89A2RUT3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM89A2RUT3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM89A2RUT3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM89A2RUT3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM89A2RUT3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM89A2RUT3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM89A2RUT3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM89A2RUT3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM89A2RUT3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM89A2RUT3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM89A2RUT3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM89A2RUT3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM89A2RUT3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM89A2RUT3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM89A2RUT3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM89A2RUT3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM89A2RUT3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM89A2RUT3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM89A2RUT3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM89A2RUT3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM89A2RUT3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM89A2RUT3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMEM89A2RUT3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM89A2RUT3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM89A2RUT3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM89A2RUT3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM89A2RUT3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM89A2RUT3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM89A2RUT3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM89A2RUT3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM89A2RUT3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM89A2RUT3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM89A2RUT3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM89A2RUT3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM89A2RUT3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM89A2RUT3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM89A2RUT3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM89A2RUT3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM89A2RUT3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM89A2RUT3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM89A2RUT3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM89A2RUT3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM89A2RUT3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM89A2RUT3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM89A2RUT3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM89A2RUT3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM89A2RUT3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM89A2RUT3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM89A2RUT3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM89A2RUT3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM89A2RUT3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM89A2RUT3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM89A2RUT3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM89A2RUT3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM89A2RUT3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM89A2RUT3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM89A2RUT3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM89A2RUT3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM89A2RUT3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM89A2RUT3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM89A2RUT3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM89A2RUT3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM89A2RUT3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM89A2RUT3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM89A2RUT3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM89A2RUT3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM89A2RUT3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM89A2RUT3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM89A2RUT3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM89A2RUT3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM89A2RUT3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM89A2RUT3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM89A2RUT3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM89A2RUT3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM89A2RUT3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM89A2RUT3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM89A2RUT3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM89A2RUT3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM89A2RUT3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM89A2RUT3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM89A2RUT3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM89A2RUT3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM89A2RUT3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM89A2RUT3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM89A2RUT3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM89A2RUT3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM89A2RUT3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM89A2RUT3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM89A2RUT3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM89A2RUT3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM89A2RUT3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM89A2RUT3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM89A2RUT3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms