Protein–RNA interactions for Protein: A2A288

ZC3H12D, Probable ribonuclease ZC3H12D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12DA2A288 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZC3H12DA2A288 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZC3H12DA2A288 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZC3H12DA2A288 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZC3H12DA2A288 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZC3H12DA2A288 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZC3H12DA2A288 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZC3H12DA2A288 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZC3H12DA2A288 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZC3H12DA2A288 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZC3H12DA2A288 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZC3H12DA2A288 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZC3H12DA2A288 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZC3H12DA2A288 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZC3H12DA2A288 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZC3H12DA2A288 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZC3H12DA2A288 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZC3H12DA2A288 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZC3H12DA2A288 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZC3H12DA2A288 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZC3H12DA2A288 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ZC3H12DA2A288 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZC3H12DA2A288 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZC3H12DA2A288 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZC3H12DA2A288 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZC3H12DA2A288 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZC3H12DA2A288 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZC3H12DA2A288 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZC3H12DA2A288 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZC3H12DA2A288 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZC3H12DA2A288 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZC3H12DA2A288 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZC3H12DA2A288 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZC3H12DA2A288 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZC3H12DA2A288 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZC3H12DA2A288 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZC3H12DA2A288 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZC3H12DA2A288 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZC3H12DA2A288 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZC3H12DA2A288 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZC3H12DA2A288 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZC3H12DA2A288 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZC3H12DA2A288 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZC3H12DA2A288 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZC3H12DA2A288 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZC3H12DA2A288 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZC3H12DA2A288 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZC3H12DA2A288 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZC3H12DA2A288 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZC3H12DA2A288 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZC3H12DA2A288 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZC3H12DA2A288 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZC3H12DA2A288 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZC3H12DA2A288 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZC3H12DA2A288 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZC3H12DA2A288 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZC3H12DA2A288 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZC3H12DA2A288 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZC3H12DA2A288 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZC3H12DA2A288 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZC3H12DA2A288 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZC3H12DA2A288 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZC3H12DA2A288 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZC3H12DA2A288 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZC3H12DA2A288 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZC3H12DA2A288 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC3H12DA2A288 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC3H12DA2A288 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC3H12DA2A288 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZC3H12DA2A288 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZC3H12DA2A288 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZC3H12DA2A288 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZC3H12DA2A288 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZC3H12DA2A288 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC3H12DA2A288 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC3H12DA2A288 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC3H12DA2A288 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC3H12DA2A288 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZC3H12DA2A288 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZC3H12DA2A288 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZC3H12DA2A288 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZC3H12DA2A288 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZC3H12DA2A288 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZC3H12DA2A288 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZC3H12DA2A288 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC3H12DA2A288 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC3H12DA2A288 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC3H12DA2A288 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC3H12DA2A288 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZC3H12DA2A288 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZC3H12DA2A288 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZC3H12DA2A288 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZC3H12DA2A288 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZC3H12DA2A288 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZC3H12DA2A288 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZC3H12DA2A288 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZC3H12DA2A288 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZC3H12DA2A288 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZC3H12DA2A288 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZC3H12DA2A288 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms