Protein–RNA interactions for Protein: A0AVI4

TMEM129, E3 ubiquitin-protein ligase TM129, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM129A0AVI4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM129A0AVI4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM129A0AVI4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM129A0AVI4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM129A0AVI4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM129A0AVI4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM129A0AVI4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM129A0AVI4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM129A0AVI4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM129A0AVI4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM129A0AVI4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM129A0AVI4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM129A0AVI4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM129A0AVI4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM129A0AVI4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM129A0AVI4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM129A0AVI4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM129A0AVI4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM129A0AVI4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM129A0AVI4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM129A0AVI4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM129A0AVI4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM129A0AVI4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM129A0AVI4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM129A0AVI4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM129A0AVI4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM129A0AVI4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM129A0AVI4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM129A0AVI4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM129A0AVI4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM129A0AVI4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM129A0AVI4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM129A0AVI4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM129A0AVI4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM129A0AVI4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM129A0AVI4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM129A0AVI4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM129A0AVI4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM129A0AVI4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM129A0AVI4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM129A0AVI4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM129A0AVI4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM129A0AVI4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM129A0AVI4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM129A0AVI4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM129A0AVI4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM129A0AVI4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM129A0AVI4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM129A0AVI4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM129A0AVI4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM129A0AVI4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM129A0AVI4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM129A0AVI4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM129A0AVI4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM129A0AVI4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM129A0AVI4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM129A0AVI4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM129A0AVI4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM129A0AVI4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM129A0AVI4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM129A0AVI4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM129A0AVI4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM129A0AVI4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM129A0AVI4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM129A0AVI4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM129A0AVI4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM129A0AVI4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM129A0AVI4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM129A0AVI4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM129A0AVI4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM129A0AVI4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM129A0AVI4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM129A0AVI4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM129A0AVI4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM129A0AVI4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM129A0AVI4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM129A0AVI4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM129A0AVI4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM129A0AVI4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM129A0AVI4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM129A0AVI4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM129A0AVI4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM129A0AVI4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM129A0AVI4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM129A0AVI4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM129A0AVI4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM129A0AVI4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM129A0AVI4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM129A0AVI4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM129A0AVI4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM129A0AVI4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM129A0AVI4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM129A0AVI4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM129A0AVI4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM129A0AVI4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM129A0AVI4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM129A0AVI4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM129A0AVI4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM129A0AVI4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM129A0AVI4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms