Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YY10

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YY10 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A0J9YY10 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A0J9YY10 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
A0A0J9YY10 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
A0A0J9YY10 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
A0A0J9YY10 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A0J9YY10 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A0J9YY10 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A0J9YY10 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A0J9YY10 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A0J9YY10 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A0J9YY10 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A0J9YY10 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A0J9YY10 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A0J9YY10 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A0J9YY10 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A0J9YY10 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A0J9YY10 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A0J9YY10 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A0J9YY10 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A0J9YY10 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
A0A0J9YY10 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
A0A0J9YY10 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0J9YY10 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0J9YY10 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0J9YY10 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A0J9YY10 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A0J9YY10 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A0J9YY10 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A0J9YY10 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A0J9YY10 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A0J9YY10 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A0J9YY10 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A0J9YY10 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A0J9YY10 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A0J9YY10 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A0J9YY10 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A0J9YY10 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A0J9YY10 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A0J9YY10 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A0J9YY10 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A0J9YY10 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
A0A0J9YY10 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A0J9YY10 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A0J9YY10 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A0J9YY10 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A0J9YY10 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A0J9YY10 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A0J9YY10 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A0J9YY10 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A0J9YY10 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
A0A0J9YY10 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
A0A0J9YY10 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
A0A0J9YY10 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
A0A0J9YY10 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
A0A0J9YY10 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
A0A0J9YY10 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
A0A0J9YY10 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A0J9YY10 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A0J9YY10 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
A0A0J9YY10 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
A0A0J9YY10 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
A0A0J9YY10 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
A0A0J9YY10 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A0J9YY10 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A0J9YY10 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A0J9YY10 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A0J9YY10 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A0J9YY10 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A0J9YY10 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A0J9YY10 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A0J9YY10 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A0J9YY10 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0J9YY10 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0J9YY10 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0J9YY10 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0J9YY10 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0J9YY10 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0J9YY10 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0J9YY10 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0J9YY10 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0J9YY10 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0J9YY10 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0J9YY10 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0J9YY10 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A0J9YY10 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0J9YY10 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0J9YY10 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0J9YY10 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0J9YY10 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0J9YY10 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
A0A0J9YY10 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A0J9YY10 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A0J9YY10 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A0J9YY10 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A0J9YY10 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A0J9YY10 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A0J9YY10 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0J9YY10 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A0J9YY10 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms