Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 CDIPT-AS1-203ENST00000638164 713 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AP000533.2-201ENST00000417863 2260 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 MYO1C-202ENST00000361007 4734 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 SEMA3F-206ENST00000434342 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 G2E3-202ENST00000438909 2334 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 FAM71F1-201ENST00000315184 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 MCM7-201ENST00000303887 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AL645944.2-201ENST00000641702 1953 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 ZNF180-211ENST00000592529 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 CD164-204ENST00000413644 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 ZNF239-202ENST00000374446 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 IRAK1-202ENST00000369974 3319 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 PTPRR-209ENST00000549308 1603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 STAT6-220ENST00000556155 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 WARS2-IT1-201ENST00000423984 2060 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 NOSTRIN-203ENST00000397209 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AC105415.1-201ENST00000509015 1416 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 SEC61A1-203ENST00000464451 1871 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 RPL10-204ENST00000424325 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 TOM1L1-213ENST00000572405 2337 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 BRD2-205ENST00000449085 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 EIF4B-203ENST00000420463 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 PCYT1A-206ENST00000431016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 LIPC-204ENST00000433326 1484 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AC010201.2-201ENST00000605595 1495 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 HYPK-203ENST00000458412 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 LAS1L-203ENST00000374811 2439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 C1orf158-201ENST00000376210 695 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 PGAM1P7-201ENST00000413837 737 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 LINC01135-201ENST00000419531 996 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 NDUFC1-206ENST00000505036 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AC110753.1-201ENST00000505711 1022 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AC104819.2-201ENST00000507181 163 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 FAM153C-208ENST00000511189 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 LYPLA1P2-201ENST00000513113 691 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 ALG10-202ENST00000538927 571 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AC092745.1-202ENST00000539795 602 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AC007731.1-203ENST00000583722 474 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 CD300LF-210ENST00000583937 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 FAM230A-201ENST00000615181 315 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 IGSF11-204ENST00000441144 1952 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 MANBA-201ENST00000226578 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 CHTF8P1-201ENST00000414660 1541 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 CPNE4-201ENST00000429747 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 GPT2-202ENST00000440783 4228 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 USF1-203ENST00000368021 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 GPD1-201ENST00000301149 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 EDRF1-201ENST00000337623 4387 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 NLRP2-206ENST00000427260 3411 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 ABR-201ENST00000291107 2673 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 JAK3-204ENST00000527670 3996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AURKA-207ENST00000395914 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 ACTR1A-201ENST00000369905 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 SLC10A1-201ENST00000216540 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 GNL3-202ENST00000418458 2040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 PEX5L-213ENST00000476138 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 SUV39H1-201ENST00000337852 2978 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 CLK2P1-201ENST00000416636 1294 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AL356417.2-201ENST00000419064 395 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 HOTAIRM1-202ENST00000428939 889 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 DHRSX-IT1-201ENST00000437244 651 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AC109779.1-202ENST00000439810 579 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 IP6K2-222ENST00000450045 689 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AL354676.1-201ENST00000458047 368 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 RN7SL186P-201ENST00000466485 297 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 RN7SL386P-201ENST00000485776 297 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 ZNF213-AS1-202ENST00000571449 919 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 DNAJB14-212ENST00000610281 339 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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