RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549308.5

PTPRR-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-209ENST00000549308 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.7■■■□□ 2.03
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PTPRR-209ENST00000549308 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.5■■□□□ 1.19
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PTPRR-209ENST00000549308 SCRIBQ14160 1630 aa22.29■■□□□ 1.16
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PTPRR-209ENST00000549308 GRIN2BQ13224 1484 aa19.36■□□□□ 0.69
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PTPRR-209ENST00000549308 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRR-209ENST00000549308 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
PTPRR-209ENST00000549308 CLIP1P30622 1438 aa19.21■□□□□ 0.67
PTPRR-209ENST00000549308 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
PTPRR-209ENST00000549308 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRR-209ENST00000549308 SYNJ2O15056 1496 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRR-209ENST00000549308 GRIN2AQ12879 1464 aa19.12■□□□□ 0.65
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