Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 DNM1-204ENST00000441149 3286 ntTSL 1 (best)21.48■■□□□ 1.034e-8■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 DNM1-227ENST00000637999 1429 ntTSL 518.81■□□□□ 0.64e-8■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 DNM1-207ENST00000482638 672 ntTSL 514.06□□□□□ -0.164e-8■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 PISD-213ENST00000474017 1760 ntTSL 526.84■■□□□ 1.897e-7■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 PISD-206ENST00000431201 460 ntTSL 424.1■■□□□ 1.457e-7■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 PISD-205ENST00000429683 609 ntTSL 324.1■■□□□ 1.457e-7■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 PISD-212ENST00000473770 2378 ntTSL 523.5■■□□□ 1.357e-7■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 PISD-217ENST00000491342 692 ntTSL 523■■□□□ 1.277e-7■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.057e-7■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 PISD-211ENST00000460723 2534 ntTSL 1 (best)19.99■□□□□ 0.797e-7■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 PISD-203ENST00000397500 2194 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.687e-7■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 PISD-208ENST00000437808 2264 ntTSL 517.73■□□□□ 0.437e-7■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 PISD-207ENST00000435900 1723 ntTSL 516.89■□□□□ 0.297e-7■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 PISD-201ENST00000266095 2655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.117e-7■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.93■■■■■ 5.424e-8■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.444e-7■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.024e-7■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 ZFYVE21-203ENST00000553512 636 ntTSL 533.39■■■□□ 2.944e-8■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.074e-8■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 ZFYVE21-205ENST00000554255 570 ntTSL 225.95■■□□□ 1.754e-8■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 ZFYVE21-210ENST00000556610 364 ntTSL 523.73■■□□□ 1.394e-8■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 ZFYVE21-206ENST00000554630 566 ntTSL 223.4■■□□□ 1.344e-8■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 ZNF276-209ENST00000568295 2206 ntTSL 237.9■■■■□ 3.661e-10■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.251e-10■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31e-10■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 CORO1C-216ENST00000551059 474 ntTSL 228.73■■■□□ 2.198e-8■■■■□ 26.1
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DROSHAQ9NRR4 CORO1C-219ENST00000552871 587 ntTSL 328.08■■■□□ 2.098e-8■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 CORO1C-210ENST00000549384 891 ntTSL 527.91■■■□□ 2.068e-8■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 ZNF276-204ENST00000562530 1826 ntTSL 224.11■■□□□ 1.451e-10■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 MRPL21-207ENST00000565125 2283 ntTSL 523.76■■□□□ 1.398e-8■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.781e-10■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 MRPL21-201ENST00000362034 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.378e-8■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 ZNF276-206ENST00000563983 3403 ntTSL 216.08■□□□□ 0.171e-10■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 MRPL21-205ENST00000541279 764 ntTSL 515.7■□□□□ 0.18e-8■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 CORO1C-201ENST00000261401 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.038e-8■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 CORO1C-217ENST00000551550 547 ntTSL 414.75□□□□□ -0.058e-8■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 MRPL21-202ENST00000450904 662 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.058e-8■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 MAD1L1-214ENST00000459731 371 ntTSL 316.21■□□□□ 0.192e-6■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 SDF4-206ENST00000478938 2591 ntTSL 227.86■■■□□ 2.059e-8■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 SDF4-207ENST00000494748 3516 ntTSL 221.73■■□□□ 1.079e-8■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 TBCD-225ENST00000576996 827 ntTSL 522.76■■□□□ 1.233e-8■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 TBCD-206ENST00000571712 850 ntTSL 517.07■□□□□ 0.323e-8■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 TBCD-219ENST00000576160 942 ntTSL 515.3■□□□□ 0.043e-8■■■■□ 26.1
DROSHAQ9NRR4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.27■□□□□ 0.844e-8■■■■□ 26
DROSHAQ9NRR4 NPIPA1-203ENST00000472413 5345 ntTSL 219.54■□□□□ 0.724e-8■■■■□ 26
DROSHAQ9NRR4 NPIPA1-206ENST00000541836 2747 ntTSL 518.81■□□□□ 0.64e-8■■■■□ 26
DROSHAQ9NRR4 C1orf159-213ENST00000472741 661 ntTSL 428.82■■■□□ 2.21e-9■■■■□ 26
DROSHAQ9NRR4 C1orf159-217ENST00000480643 579 ntTSL 423.72■■□□□ 1.391e-9■■■■□ 26
DROSHAQ9NRR4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.463e-7■■■■□ 26
DROSHAQ9NRR4 RPH3AL-221ENST00000577079 814 ntAPPRIS ALT2 TSL 325.73■■□□□ 1.713e-7■■■■□ 26
DROSHAQ9NRR4 RPH3AL-218ENST00000575736 566 ntTSL 525.47■■□□□ 1.673e-7■■■■□ 26
DROSHAQ9NRR4 RPH3AL-220ENST00000576420 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 324.79■■□□□ 1.563e-7■■■■□ 26
DROSHAQ9NRR4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.53e-7■■■■□ 26
DROSHAQ9NRR4 RPH3AL-215ENST00000574953 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 523.88■■□□□ 1.413e-7■■■■□ 26
DROSHAQ9NRR4 RPH3AL-204ENST00000570638 537 ntTSL 523.67■■□□□ 1.383e-7■■■■□ 26
DROSHAQ9NRR4 RPH3AL-214ENST00000574722 586 ntTSL 423.67■■□□□ 1.383e-7■■■■□ 26
DROSHAQ9NRR4 RPH3AL-219ENST00000576001 647 ntTSL 323.52■■□□□ 1.363e-7■■■■□ 26
DROSHAQ9NRR4 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.183e-7■■■■□ 26
DROSHAQ9NRR4 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.093e-7■■■■□ 26
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DROSHAQ9NRR4 EEF1D-228ENST00000529832 600 ntTSL 428.62■■■□□ 2.175e-9■■■■□ 25.9
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-209ENST00000524900 343 ntTSL 526.98■■□□□ 1.915e-9■■■■□ 25.9
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DROSHAQ9NRR4 EEF1D-245ENST00000532596 761 ntTSL 422.63■■□□□ 1.215e-9■■■■□ 25.9
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DROSHAQ9NRR4 EEF1D-255ENST00000534804 555 ntTSL 412.91□□□□□ -0.345e-9■■■■□ 25.9
DROSHAQ9NRR4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.562e-6■■■■□ 25.9
DROSHAQ9NRR4 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.771e-15■■■■□ 25.8
DROSHAQ9NRR4 PAK4-204ENST00000593480 714 ntTSL 330.56■■■□□ 2.482e-6■■■■□ 25.8
DROSHAQ9NRR4 PAK4-212ENST00000602004 564 ntTSL 429.14■■■□□ 2.262e-6■■■■□ 25.8
DROSHAQ9NRR4 PAK4-207ENST00000597766 380 ntTSL 328.11■■■□□ 2.092e-6■■■■□ 25.8
DROSHAQ9NRR4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.962e-6■■■■□ 25.8
DROSHAQ9NRR4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.662e-6■■■■□ 25.8
DROSHAQ9NRR4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.422e-6■■■■□ 25.8
DROSHAQ9NRR4 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.182e-6■■■■□ 25.8
DROSHAQ9NRR4 NRIP1-205ENST00000637630 573 ntTSL 318.62■□□□□ 0.573e-7■■■■□ 25.8
DROSHAQ9NRR4 NRIP1-207ENST00000638122 543 ntTSL 1 (best)18.52■□□□□ 0.553e-7■■■■□ 25.8
DROSHAQ9NRR4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.512e-6■■■■□ 25.8
DROSHAQ9NRR4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.483e-7■■■■□ 25.8
DROSHAQ9NRR4 NRIP1-206ENST00000637963 498 ntTSL 416.91■□□□□ 0.33e-7■■■■□ 25.8
DROSHAQ9NRR4 NRIP1-202ENST00000400199 7562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.263e-7■■■■□ 25.8
DROSHAQ9NRR4 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.223e-7■■■■□ 25.8
DROSHAQ9NRR4 CTDSP1-213ENST00000496785 460 ntTSL 529.49■■■□□ 2.311e-8■■■■□ 25.8
DROSHAQ9NRR4 SPSB3-209ENST00000567868 1628 ntTSL 334.08■■■■□ 3.051e-6■■■■□ 25.8
DROSHAQ9NRR4 SPSB3-203ENST00000563705 876 ntTSL 532.63■■■□□ 2.811e-6■■■■□ 25.8
DROSHAQ9NRR4 SPSB3-206ENST00000564709 2316 ntTSL 232.35■■■□□ 2.771e-6■■■■□ 25.8
DROSHAQ9NRR4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.561e-6■■■■□ 25.8
DROSHAQ9NRR4 SPSB3-211ENST00000569380 1781 ntTSL 230.97■■■□□ 2.551e-6■■■■□ 25.8
DROSHAQ9NRR4 SPSB3-207ENST00000565550 898 ntTSL 229.58■■■□□ 2.331e-6■■■■□ 25.8
DROSHAQ9NRR4 SPSB3-204ENST00000563741 1746 ntTSL 529.37■■■□□ 2.291e-6■■■■□ 25.8
DROSHAQ9NRR4 SPSB3-205ENST00000564070 714 ntTSL 324.62■■□□□ 1.531e-6■■■■□ 25.8
DROSHAQ9NRR4 SPSB3-212ENST00000569769 580 ntTSL 319.44■□□□□ 0.71e-6■■■■□ 25.8
DROSHAQ9NRR4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.181e-7■■■■□ 25.8
DROSHAQ9NRR4 POLR2H-201ENST00000412877 836 ntTSL 233.6■■■□□ 2.971e-7■■■■□ 25.8
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