RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568295.5

ZNF276-209, Transcript of zinc finger protein 276, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF276, Length 2,206 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF276-209ENST00000568295 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.87■■■■■ 6.53
ZNF276-209ENST00000568295 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.12■■■■■ 5.29
ZNF276-209ENST00000568295 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.12■■■■■ 5.13
ZNF276-209ENST00000568295 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.67■■■■■ 5.06
ZNF276-209ENST00000568295 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.2■■■■■ 4.99
ZNF276-209ENST00000568295 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.99■■■■■ 4.95
ZNF276-209ENST00000568295 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.31■■■■■ 4.84
ZNF276-209ENST00000568295 ABCC9O60706 1549 aa45.03■■■■■ 4.8
ZNF276-209ENST00000568295 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.03■■■■■ 4.8
ZNF276-209ENST00000568295 SCRIBQ14160 1630 aa44.72■■■■■ 4.75
ZNF276-209ENST00000568295 NACADO15069 1562 aa44.62■■■■■ 4.73
ZNF276-209ENST00000568295 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.06■■■■■ 4.64
ZNF276-209ENST00000568295 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.78■■■■■ 4.6
ZNF276-209ENST00000568295 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.72■■■■■ 4.59
ZNF276-209ENST00000568295 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.52■■■■■ 4.56
ZNF276-209ENST00000568295 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.38■■■■■ 4.54
ZNF276-209ENST00000568295 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.32■■■■■ 4.53
ZNF276-209ENST00000568295 WIZO95785 1651 aa43.06■■■■■ 4.48
ZNF276-209ENST00000568295 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.03■■■■■ 4.48
ZNF276-209ENST00000568295 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.84■■■■■ 4.45
ZNF276-209ENST00000568295 SMARCA4P51532 1647 aa42.78■■■■■ 4.44
ZNF276-209ENST00000568295 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.74■■■■■ 4.43
ZNF276-209ENST00000568295 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.47■■■■■ 4.39
ZNF276-209ENST00000568295 TRIM41Q8WV44 630 aa42.36■■■■■ 4.37
ZNF276-209ENST00000568295 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.26■■■■■ 4.35
ZNF276-209ENST00000568295 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
ZNF276-209ENST00000568295 SMARCA2P51531 1590 aa42.17■■■■■ 4.34
ZNF276-209ENST00000568295 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.15■■■■■ 4.34
ZNF276-209ENST00000568295 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.07■■■■■ 4.33
ZNF276-209ENST00000568295 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.85■■■■■ 4.29
ZNF276-209ENST00000568295 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.84■■■■■ 4.29
ZNF276-209ENST00000568295 ABCC8Q09428 1581 aa41.71■■■■■ 4.27
ZNF276-209ENST00000568295 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.68■■■■■ 4.26
ZNF276-209ENST00000568295 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.42■■■■■ 4.22
ZNF276-209ENST00000568295 PCGF6Q9BYE7 350 aa41.32■■■■■ 4.2
ZNF276-209ENST00000568295 HMGXB3Q12766 1538 aa41.23■■■■■ 4.19
ZNF276-209ENST00000568295 NCAPD3P42695 1498 aa41.21■■■■■ 4.19
ZNF276-209ENST00000568295 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.17■■■■■ 4.185e-8■■□□□ 12.1
ZNF276-209ENST00000568295 SOGA1O94964 1423 aa41.1■■■■■ 4.17
ZNF276-209ENST00000568295 SYNJ1O43426 1573 aa41.04■■■■■ 4.16
ZNF276-209ENST00000568295 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.93■■■■■ 4.14
ZNF276-209ENST00000568295 EEA1Q15075 1411 aa40.91■■■■■ 4.14
ZNF276-209ENST00000568295 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP40.86■■■■■ 4.13
ZNF276-209ENST00000568295 HRCP23327 699 aa40.77■■■■■ 4.12
ZNF276-209ENST00000568295 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.77■■■■■ 4.12
ZNF276-209ENST00000568295 TOP2BQ02880 1626 aa40.67■■■■■ 4.1
ZNF276-209ENST00000568295 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.66■■■■■ 4.1
ZNF276-209ENST00000568295 CFTRP13569 1480 aa40.62■■■■■ 4.09
ZNF276-209ENST00000568295 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.59■■■■■ 4.09
ZNF276-209ENST00000568295 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.56■■■■■ 4.08
ZNF276-209ENST00000568295 CEP162Q5TB80 1403 aa40.54■■■■■ 4.08
ZNF276-209ENST00000568295 GOLGA3Q08378 1498 aa40.54■■■■■ 4.08
ZNF276-209ENST00000568295 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.46■■■■■ 4.07
ZNF276-209ENST00000568295 CUX1P39880 1505 aa40.43■■■■■ 4.06
ZNF276-209ENST00000568295 KIF21BO75037 1637 aa40.42■■■■■ 4.06
ZNF276-209ENST00000568295 PRDM2Q13029 1718 aa40.42■■■■■ 4.06
ZNF276-209ENST00000568295 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.42■■■■■ 4.06
ZNF276-209ENST00000568295 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
ZNF276-209ENST00000568295 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.3■■■■■ 4.04
ZNF276-209ENST00000568295 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.19■■■■■ 4.02
ZNF276-209ENST00000568295 KIF27Q86VH2 1401 aa40■■■■□ 3.99
ZNF276-209ENST00000568295 CLIP1P30622 1438 aa39.98■■■■□ 3.99
ZNF276-209ENST00000568295 PRXQ9BXM0 1461 aa39.97■■■■□ 3.99
ZNF276-209ENST00000568295 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.94■■■■□ 3.98
ZNF276-209ENST00000568295 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.92■■■■□ 3.98
ZNF276-209ENST00000568295 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP39.88■■■■□ 3.97
ZNF276-209ENST00000568295 NESP48681 1621 aa39.85■■■■□ 3.97
ZNF276-209ENST00000568295 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.83■■■■□ 3.97
ZNF276-209ENST00000568295 CUX2O14529 1486 aa39.78■■■■□ 3.96
ZNF276-209ENST00000568295 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.77■■■■□ 3.96
ZNF276-209ENST00000568295 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.72■■■■□ 3.95
ZNF276-209ENST00000568295 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.67■■■■□ 3.94
ZNF276-209ENST00000568295 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.66■■■■□ 3.94
ZNF276-209ENST00000568295 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.61■■■■□ 3.93
ZNF276-209ENST00000568295 IGF1RP08069 1367 aa39.59■■■■□ 3.93
ZNF276-209ENST00000568295 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP39.59■■■■□ 3.93
ZNF276-209ENST00000568295 TOPBP1Q92547 1522 aa39.59■■■■□ 3.93
ZNF276-209ENST00000568295 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.49■■■■□ 3.91
ZNF276-209ENST00000568295 ARAP1Q96P48 1450 aa39.49■■■■□ 3.91
ZNF276-209ENST00000568295 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.47■■■■□ 3.91
ZNF276-209ENST00000568295 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.41■■■■□ 3.9
ZNF276-209ENST00000568295 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.41■■■■□ 3.9
ZNF276-209ENST00000568295 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.4■■■■□ 3.9
ZNF276-209ENST00000568295 APLP2Q06481 763 aa39.38■■■■□ 3.9
ZNF276-209ENST00000568295 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.36■■■■□ 3.89
ZNF276-209ENST00000568295 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.34■■■■□ 3.89
ZNF276-209ENST00000568295 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.29■■■■□ 3.88
ZNF276-209ENST00000568295 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.29■■■■□ 3.88
ZNF276-209ENST00000568295 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP39.21■■■■□ 3.87
ZNF276-209ENST00000568295 WDR97A6NE52 1622 aa39.21■■■■□ 3.87
ZNF276-209ENST00000568295 CUL7Q14999 1698 aa39.1■■■■□ 3.85
ZNF276-209ENST00000568295 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.04■■■■□ 3.84
ZNF276-209ENST00000568295 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.01■■■■□ 3.84
ZNF276-209ENST00000568295 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP38.99■■■■□ 3.83
ZNF276-209ENST00000568295 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP38.97■■■■□ 3.83
ZNF276-209ENST00000568295 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.93■■■■□ 3.82
ZNF276-209ENST00000568295 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.9■■■■□ 3.82
ZNF276-209ENST00000568295 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.88■■■■□ 3.81
ZNF276-209ENST00000568295 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.83■■■■□ 3.81
ZNF276-209ENST00000568295 P3H3Q8IVL6 736 aa38.78■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.1 ms